Show simple item record

Nekovalentní interakce v plynné fázi a vodném roztoku: Teoretické studium
dc.contributor.advisorHobza, Pavel
dc.creatorZendlová, Lucie
dc.date.accessioned2019-05-03T14:36:34Z
dc.date.available2019-05-03T14:36:34Z
dc.date.issued2008
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/13887
dc.description.abstractEAPUr rr|lclltal \ alLlť5' 5 Conclusions :, , . In the ia) part of present work we c intera cti on b etween u d"',il ". . . thy;';; il:'::: :íJTj.:lÍ' lI jl.#.ffiJ,lil itt8:"é'siia small number or*u.",7nJ organió solvent ňr"."i", (CH3.H, solvents yů[T"i^f.completely different interactions between the bases and the b"''" p.'"{ ;' "idilnn il#} il-t ÍT:!fl,-. i: : " o:] Y" .'h:.-S,t.* tu,", ot tt," moleóule Iuórc 'u'r' u property, and the'. .'l,'..,ťff,.'*lt'Lť':.lill:ilF.S'T!,l;situated above or belolthe !Á; ;;i. ;';;lě'"o ri," olašó ň"l"-.\,," ,, unique y"J::fiffii:x::. ."n'o*ison with otr,!. .otu"nt,, uň.'r,"í'ř;;.". are the In the ib) part_of present work based on the MD, SCC_DDFTB_D and ;"",'.Y|Tť'.#1.:."ffi i"T."lrJ'".r""u.'".XincorporateJ."-oŇTduplexwe i) Replacing nucleic acid base by modified nucleobase X leads.*:'] ,o Structural changes of the centrď -uuš"-pui. Gtu.tarrangement of central modified base pairs). ónli with ttresma'lest modified nucleobase p 'r'" Á.iJ.;;*;;.í' (A-P, P-T) stay planar. In the case 'of.B-T, Á-il.;';6 in specificorientation, one of the modified nuú"JÁ""x"*íto.""a outfrom DNA duplex. ii) Incre, .,""olr'iT"i1iTi1fi" or modified nucleobase X increases rhe iii) The highest s.ďectivity among- all base ana|ogue studied wasfound for modified nu"l"obus" O In the secono pu* of...en_US
dc.description.abstract5 Zál,ěr \/ části ia) prezentované práce jsme porovnali stabilitu a molekulovou interakci mezi adeninem...tyminem, guaninem...cýosinem a jejímimetylovanými 11alogy s malým počtem molekul vody a organických rožpouŠtědel.(CH3óH, DMSO a CHCI3). Pozorovali jsme odlišnéinterakce mezibázemi a studovanými solventy. Zatimco voda a CH3OH stabilizují S struktury párit bazi vetšímpočtem vodíkových vazeb než je moŽno v HB strukturacň, čHct:molekula nemá tuto v|astnost a jsou preferovány HB struktury s molekulami rozpouštědla nad a pod rovinou bází. DMSo molekula je jedinečná svou velikostí ve srovnání s ostatními rozpouštědly a mezi páry bazí s DMSo rozpouštědlem jsou nejvíce zastoupené jsou T struktury. . V části ib) prezentované práce jsme dospěli k několika závěrum za|oženýmna MD, SCC-DFTB-D a CoSMo výpočtech: i) nahrazení nukleové báze modifikovanou nukleobází X vede převážně ke strukturálním změnám centrálního páru (patrové uspořádání centrálního modifikovaného páru). Pouze s nejmenšími modifikovanými nukleobázemi P' centrá,lni pár bazí (A-P' P-T a P-P) zustane planární. V případě B-T' A-B nebo D- D ve specifické orientaci je jedna z modifikovaných bazi X výIačenaven z DNA duplexu. ii) Se stoupajícíaromaticitou modifikovaných nukleobazí X roste stabilita patrového uspořádání iii) Nejvyššíselektivita mezi všemi...cs_CZ
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.titleNoncovalent Interactions in the Gas Phase and Aqueous Solution: Theoretical Studyen_US
dc.typedizertační prácecs_CZ
dcterms.created2008
dcterms.dateAccepted2008-06-24
dc.description.departmentDepartment of Physical and Macromolecular Chemistryen_US
dc.description.departmentKatedra fyzikální a makromol. chemiecs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.identifier.repId112570
dc.title.translatedNekovalentní interakce v plynné fázi a vodném roztoku: Teoretické studiumcs_CZ
dc.contributor.refereeBurda, Jaroslav
dc.contributor.refereeVondrášek, Jiří
dc.contributor.refereeJurečka, Petr
dc.identifier.aleph001010236
thesis.degree.namePh.D.
thesis.degree.leveldoktorskécs_CZ
thesis.degree.discipline-cs_CZ
thesis.degree.discipline-en_US
thesis.degree.programMakromolekulární chemiecs_CZ
thesis.degree.programMacromolecular Chemistryen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.cs-cs_CZ
uk.degree-discipline.en-en_US
uk.degree-program.csMakromolekulární chemiecs_CZ
uk.degree-program.enMacromolecular Chemistryen_US
thesis.grade.csProspěl/acs_CZ
thesis.grade.enPassen_US
uk.abstract.cs5 Zál,ěr \/ části ia) prezentované práce jsme porovnali stabilitu a molekulovou interakci mezi adeninem...tyminem, guaninem...cýosinem a jejímimetylovanými 11alogy s malým počtem molekul vody a organických rožpouŠtědel.(CH3óH, DMSO a CHCI3). Pozorovali jsme odlišnéinterakce mezibázemi a studovanými solventy. Zatimco voda a CH3OH stabilizují S struktury párit bazi vetšímpočtem vodíkových vazeb než je moŽno v HB strukturacň, čHct:molekula nemá tuto v|astnost a jsou preferovány HB struktury s molekulami rozpouštědla nad a pod rovinou bází. DMSo molekula je jedinečná svou velikostí ve srovnání s ostatními rozpouštědly a mezi páry bazí s DMSo rozpouštědlem jsou nejvíce zastoupené jsou T struktury. . V části ib) prezentované práce jsme dospěli k několika závěrum za|oženýmna MD, SCC-DFTB-D a CoSMo výpočtech: i) nahrazení nukleové báze modifikovanou nukleobází X vede převážně ke strukturálním změnám centrálního páru (patrové uspořádání centrálního modifikovaného páru). Pouze s nejmenšími modifikovanými nukleobázemi P' centrá,lni pár bazí (A-P' P-T a P-P) zustane planární. V případě B-T' A-B nebo D- D ve specifické orientaci je jedna z modifikovaných bazi X výIačenaven z DNA duplexu. ii) Se stoupajícíaromaticitou modifikovaných nukleobazí X roste stabilita patrového uspořádání iii) Nejvyššíselektivita mezi všemi...cs_CZ
uk.abstract.enEAPUr rr|lclltal \ alLlť5' 5 Conclusions :, , . In the ia) part of present work we c intera cti on b etween u d"',il ". . . thy;';; il:'::: :íJTj.:lÍ' lI jl.#.ffiJ,lil itt8:"é'siia small number or*u.",7nJ organió solvent ňr"."i", (CH3.H, solvents yů[T"i^f.completely different interactions between the bases and the b"''" p.'"{ ;' "idilnn il#} il-t ÍT:!fl,-. i: : " o:] Y" .'h:.-S,t.* tu,", ot tt," moleóule Iuórc 'u'r' u property, and the'. .'l,'..,ťff,.'*lt'Lť':.lill:ilF.S'T!,l;situated above or belolthe !Á; ;;i. ;';;lě'"o ri," olašó ň"l"-.\,," ,, unique y"J::fiffii:x::. ."n'o*ison with otr,!. .otu"nt,, uň.'r,"í'ř;;.". are the In the ib) part_of present work based on the MD, SCC_DDFTB_D and ;"",'.Y|Tť'.#1.:."ffi i"T."lrJ'".r""u.'".XincorporateJ."-oŇTduplexwe i) Replacing nucleic acid base by modified nucleobase X leads.*:'] ,o Structural changes of the centrď -uuš"-pui. Gtu.tarrangement of central modified base pairs). ónli with ttresma'lest modified nucleobase p 'r'" Á.iJ.;;*;;.í' (A-P, P-T) stay planar. In the case 'of.B-T, Á-il.;';6 in specificorientation, one of the modified nuú"JÁ""x"*íto.""a outfrom DNA duplex. ii) Incre, .,""olr'iT"i1iTi1fi" or modified nucleobase X increases rhe iii) The highest s.ďectivity among- all base ana|ogue studied wasfound for modified nu"l"obus" O In the secono pu* of...en_US
uk.file-availabilityV
uk.publication.placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra fyzikální a makromol. chemiecs_CZ
thesis.grade.codeP


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV