Dlouhodobé sledování hladin ctDNA u pacientů s metastatickým kolorektálním karcinomem pro včasný záchyt progrese či rekurence onemocnění

Abstract

Cirkulující nádorová DNA (ctDNA) v periferní krvi pacientů s metastatickým kolorektálním karcinomem se jeví jako velmi slibný molekulárně-genetický marker, který poskytuje několik možných využití. Hladiny ctDNA kolísají v závislosti na přítomnosti a objemu nádorové masy (tumor burden) v těle pacienta, čehož se dá využít především pro včasný záchyt možné progrese, či rekurence onemocnění a při zhodnocení radikality operace, a to vše v rámci dlouhodobého sledování pacienta po operaci (tzv. follow-up). Díky minimální invazivitě vyšetření přítomnosti ctDNA z periferní krve (tzv. tekuté biopsie) je umožněno jeho opakované provádění v relativně krátkých časových intervalech. Z důvodu velmi nízkého zastoupení ctDNA v celkové volné DNA (cfDNA) v řádech jednotek až setin procent je stěžejním faktorem optimální metodika od izolace po dostatečně citlivou technologii detekce. V této diplomové práci se zabývám optimalizací izolačního procesu a analýzou ctDNA z nádorové tkáně a plazmy vybraných pacientů s metastatickým kolorektálním karcinomem v souvislosti s radikalitou operace a korelací s klinickým stavem pacienta.

Circulating tumor DNA (ctDNA) in peripheral blood of patients with metastatic colorectal cancer appears to be a promising molecular marker that provides various applications. ctDNA levels vary depending on the presence, alternatively on the volume of tumor mass within patient's body, which can be used primarily for early detection of disease progression or recurrence and moreover for evaluating radicality of surgical treatment, all within long-term postoperative follow-up of the patient. Due to minimal invasivity of ctDNA analysis from peripheral blood (so-called liquid biopsy), it is possible to perform it repeatedly at relatively short time intervals. On account of very low fraction of ctDNA in total cell-free DNA (cfDNA) ranging between units and hundreds of percent, the key factor is optimal methodology covering all steps from the isolation process to a sufficiently sensitive detection technology. In this thesis I focus on an optimization of isolation process and analysis of ctDNA obtained from tumor tissue and plasma of selected patients with metastatic colorectal cancer in connection with surgical radicality and correlation with a clinical status of the patients.