Evoluce jaderných a plastidových genomů u euglenidů

Abstract

Algae form a diverse group of simple photosynthetic eukaryotes of polyphyletic origin. Algae with a primary plastid (Archaeplastida) acquired it by ingesting cyanobacterium, a prokaryote; algae with a complex plastid acquired their plastid by ingesting another eukaryote with a primary or already complex plastid. Algae with a complex plastid are chimeras containing genes derived from the host genome, as well as genes derived from the genome of the endosymbiont, and also genetic material derived from genomes of their previous stable or transient endosymbionts. One of the groups with plastid derived from green algae are euglenophytes. This thesis deals with the genomes of three organisms that represent individual actors in the endosymbiotic process in euglenophytes. These are a heterotrophic host from the class Euglenida, a phototrophic endosymbiont from the class of green algae Prasinophyceae and the resulting phototrophic euglenid from the group Euglenophyceae. Knowledge of their genomes should illuminate the course of endosymbiotic gene transfer (EGT) in the formation of algae with a complex plastid. We annotated the plastid genome of a phototrophic euglenid Eutreptiella gymnastica and published it as the third plastome of Euglenophytes after the iconic and economically important Euglena gracilis...

Řasy tvoří rozmanitou skupinu jednoduchých fotosyntetizujících eukaryotických organismů s polyfyletickým původem. Dělí se na řasy s primárním plastidem (Archaeplastida), který tato eukaryota získala pozřením sinice, tedy prokaryota, a řasy s komplexním plastidem, které získaly plastid pozřením jiného eukaryota s primárním nebo již komplexním plastidem. Řasy s komplexním plastidem jsou chiméry obsahující geny pocházející z hostitelské buňky, a dále geny pocházející nejen z plastidu, ale také z jádra a někdy i mitochondrie endosymbionta, případně i genetický materiál pocházející od jejich předchozích stálých nebo přechodných endosymbiontů. Jednou ze skupin, která získala plastid od zelených řas, jsou krásnoočka (Euglenophyta). Tato práce se zabývá genomy tří organismů, které zastupují jednotlivé aktéry endosymbiotického procesu u euglenofyt. Jsou to původně heterotrofní hostitel ze třídy Euglenida, fototrofní endosymbiont ze třídy zelených řas Prasinophyceae a výsledný fototrofní euglenid ze skupiny Euglenophyceae. Znalost jejich genomů by měla pomoci osvětlit průběh endosymbiotického přenosu genů (EGT) při formování řas s komplexním plastidem. U zástupce fototrofních euglenidů Eutreptiella gymnastica jsme anotovali plastidový genom, který jsme publikovali jako tehdy teprve třetí ve skupině...