Fylogeografie gekonů rodu Bunopus (Squamata, Gekkonidae) na Arabském poloostrově
Phylogeography of the Bunopus geckos (Squamata, Gekkonidae) in the Arabian Peninsula
diploma thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/121979Identifiers
Study Information System: 208332
Collections
- Kvalifikační práce [19610]
Author
Advisor
Referee
Rehák, Ivan
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Zoology
Department
Department of Zoology
Date of defense
8. 9. 2020
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
Gekkota, Palearktičtí nahoprstí gekoni, biogeografieKeywords (English)
Gekkota, Palearctic naked-toed geckos, biogeographyArabský poloostrov představuje most mezi třemi kontinenty, Evropou, Asii a Afrikou a zároveň mezi dvěma zoogeografickými oblastmi, Palearktickou a Afro-tropickou (Etiopskou). Je proslulý svou bohatostí a endemicitou nejen mezi gekony, ale mezi šupinatými plazy obecně. Vedle impozantních endemických druhů v horách jsou i takové, které jsou hojně rozšířeny napříč celým Arabským poloostrovem (pan-arabské rozšíření) a z hlediska výzkumu zůstávají opomíjenými. Mezi arabskými gekony jsou ideálním příkladem gekoni rodu Bunopus, jejichž systematika a taxonomie je problematická, ačkoli se vyskytují široce po celém poloostrově. Ve snaze odpovědět na otázku možné kryptické diverzity těchto gekonů na Arabském poloostrově byla zrekonstruována fylogenetická pozice více než 80 vzorků pokrývajících převážnou část arabského areálu rozšíření, na základě sekvencí fragmentů dvou mitochondriálních (12S rRNA a COI) a dvou jaderných (RAG2 a c-mos) genů. Pro vizualizaci genealogických vztahů byly ze sekvencí jaderných genů zrekonstruovány haplotypové sítě. Výsledky fylogenetických analýz ukazují, že v porovnání s kryptickou diverzitou, jež byla dříve zjištěna na členitém území Íránu, je celý Arabský poloostrov obýván pouze dvěma liniemi, které v obou studovaných jaderných genech sdílí alely. Relativní genetickou...
The Arabian Peninsula represents a bridge between three continents and two major zoogeographic regions, the Palearctic and Afrotropical (Ethiopian). It is well known for its richness and endemicity not only among geckos, but among squamate reptiles in general. Besides impressive endemic species located in the mountains, there are some, widely distributed across the entire Arabian Peninsula (pan-arabian distribution) and in terms of research they remain neglected. Among Arabian geckos, the genus Bunopus are an excellent example, whose systematics and taxonomy are quite problematic, albeit they are distributed across the entire peninsula. In order to answer the question of possible cryptic diversity of these geckos in the Arabian Peninsula, phylogenetic position of more than 80 samples covering the vast part of their distribution range has been reconstructed based on two mitochondrial (12S rRNA and COI) and two nuclear markers (RAG2 and c-mos). Haplotype networks were reconstructed from nuclear markers in order to show genealogical relationships. Results of the phylogenetic analyses presented herein show that cryptic diversity in the Arabian Peninsula is smaller in comparison to the one that was uncovered in the Iranian Plateau. Almost entire Arabian Peninsula is inhabited by two lineages only, which...