Analýza funkce kasein kinázy γ v modelovém organismu Caenorhabditis elegans
Analysis of casein kinase γ function in the model organism Caenorhabditis elegans
diploma thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/121955Identifiers
Study Information System: 196827
Collections
- Kvalifikační práce [21679]
Author
Advisor
Referee
Obšilová, Veronika
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Cellular and Developmental Biology
Department
Department of Cell Biology
Date of defense
17. 9. 2020
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Very good
Rodina kasein kináz 1 (CK1) je důležitou součástí signalizačního aparátu všech eukaryotických organismů. Tyto serin-threoninové kinázy se zapojují do několika signálních drah důležitých pro vývoj a udržování buněčných tkání, včetně Wnt signalizace. Tuto dráhu ovlivňují kinázy CK1 rodiny různými způsoby, některé pozitivně - vedou signalizaci k expresi Wnt řízených genů a některé negativně - napomáhají degradaci transkripčního aktivátoru β-cateninu. V této práci jsme se zaměřili na kasein kinázu 1 gamma (CK1γ), která v savčích buňkách za přítomnosti Wnt signálu fosforyluje Wnt koreceptor LRP5/6. Tato fosforylace následně způsobuje vazbu a inhibici degradační komplex β-cateninu. U C. elegans tento LRP5/6 koreceptor v genomu pravděpodobně chybí, přesto však můžeme pozorovat, že CSNK-1/CK1γ Wnt signalizaci ovlivňuje. Za pomoci experimentů redukujících funkci jsme zjistili, že ztráta exprese CSNK-1 zesiluje defekty v kanonické Wnt signalizaci u mutantů se sníženou produkcí Wnt molekuly. Metodou overexprese jsme nebyli schopni odhalit tkáňovou specifitu působení CSNK-1. Abychom získali lepší nástroje pro studium funkce CSNK-1, začali jsme s optimalizací podmínek pro auxinem indukovaný degradační systém pro podmíněnou degradaci CSNK-1.
Casein kinase 1 (CK1) protein family is an important part of signalling apparatus in eukaryotic organisms. These serin-threonine kinases play roles in several important developmental and cell-maintaining signalling pathways including Wnt signalling. CK1 kinases influence this signalling pathway in various manners; some of them positively - leading to expression of Wnt regulated genes and some of them negatively - contributing to degradation of the transcription activator β-catenin. In this thesis, we were focusing on casein kinase 1 gamma (CK1γ), which in mammalian cells in the presence of Wnt signal phosphorylates Wnt co-receptor LRP5/6. This phosphorylation leads to binding and inhibition of a β-catenin degradation complex. In C. elegans LRP5/6 receptor is probably missing from the genome, yet we can still observe influence of CSNK-1/CK1γ on Wnt signalling. Using reduction-of-function experiments we have found out that loss of csnk-1 expression enhanced a canonical Wnt signalling defect in mutants with reduced Wnt production. Using overexpression approach, we were not able to uncover the tissue specificity of CSNK-1 action. In order to obtain a better tool to study the function of CSNK-1, we began to optimize conditions for the use of auxin-inducible degron system for conditional CSNK-1 depletion.
