Show simple item record

Anisotropické optické vlastnosti fluorescentních proteinů
dc.contributor.advisorLazar, Josef
dc.creatorRybakova, Olga
dc.date.accessioned2020-10-13T10:09:42Z
dc.date.available2020-10-13T10:09:42Z
dc.date.issued2020
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/121654
dc.description.abstractFluorescenční proteiny (FP) jsou velice důležité pro moderní biologické molekulární zobrazování. Důležité zobrazovací techniky (jako je polarizační mikroskopie nebo FRET zobrazování) využívají anisotropických optických vlastnosti fluorescenčních proteinů. V této práci prezentujeme výsledky polarizační mikroskopie a rentgenových difrakčních experimentů na krystalech FP, jakož i matematickou interpretaci těchto výsledků, poskytující informace o směrovosti jedno- a dvoufotonové absorpce v rámci molekul zkoumaných fluorescenčních proteinů. Pro anizotropii jenofotonové absorpce určujeme orientaci dipólových momentů přechodu ve třech reprezentativních fluorescenčních proteinech. Porovnání naměřených hodnot s dostupnými kvantově-mechanickými předpověďmi a experimentálně stanovenou orientací dipólového momentu přechodů GFP nám dává důvěru k získaným výsledkům. Pro dvoufotonovou absorpci nejprve testujeme naši hypotézu, že tenzory dvoufotonové absorptivity reprezentativních FP vykazují vektorové chování. Dále pak zkoumáme použitelnost tohoto zjednodušení jako základ pro interpretaci našich mikroskopických dat dvoufotonové polarizace.cs_CZ
dc.description.abstractFluorescent proteins (FPs) are the workhorses of biological molecular imaging. Important imaging modalities (such as polarization microscopy or FRET imaging) exploit anisotropic optical properties of fluorescent proteins. In this thesis, we present the results of our polarization microscopy and X-ray diffraction experiments on FP crystals, as well as mathematical interpretation of these results, yielding information on the directionality of one- and two-photon absorption within the investigated fluorescent protein molecules. For the anisotropy of one-photon absorption, we determine the transition dipole moment (TDM) orientations in three representative fluorescent proteins. Validation with available quantum mechanical predictions values and an experimentally determined TDM orientation of the GFP gives confidence to the results obtained. For the two-photon absorption, we first test our hypothesis that two-photon absorptivity tensors of representative FPs exhibit vector-like behaviour and then examine the applicability of this simplification as a basis for the interpretation of our two-photon polarization microscopy data.en_US
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Matematicko-fyzikální fakultacs_CZ
dc.subjectfluorescentní proteincs_CZ
dc.subjectdipólový moment přechoducs_CZ
dc.subjecttenzor dvoufotonové absorpcecs_CZ
dc.subjectfluorescent proteinen_US
dc.subjecttransition dipole momenten_US
dc.subjecttwo-photon absorptivity tensoren_US
dc.titleAnisotropické optické vlastnosti fluorescentních proteinůen_US
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2020
dcterms.dateAccepted2020-09-22
dc.description.departmentInstitute of Physics of Charles Universityen_US
dc.description.departmentFyzikální ústav UKcs_CZ
dc.description.facultyMatematicko-fyzikální fakultacs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Mathematics and Physicsen_US
dc.identifier.repId199960
dc.title.translatedAnisotropické optické vlastnosti fluorescentních proteinůcs_CZ
dc.contributor.refereeHof, Martin
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineBiofyzika a chemická fyzikacs_CZ
thesis.degree.disciplineBiophysics and Chemical Physicsen_US
thesis.degree.programPhysicsen_US
thesis.degree.programFyzikacs_CZ
uk.faculty-name.csMatematicko-fyzikální fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Mathematics and Physicsen_US
uk.faculty-abbr.csMFFcs_CZ
uk.degree-discipline.csBiofyzika a chemická fyzikacs_CZ
uk.degree-discipline.enBiophysics and Chemical Physicsen_US
uk.degree-program.csFyzikacs_CZ
uk.degree-program.enPhysicsen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csFluorescenční proteiny (FP) jsou velice důležité pro moderní biologické molekulární zobrazování. Důležité zobrazovací techniky (jako je polarizační mikroskopie nebo FRET zobrazování) využívají anisotropických optických vlastnosti fluorescenčních proteinů. V této práci prezentujeme výsledky polarizační mikroskopie a rentgenových difrakčních experimentů na krystalech FP, jakož i matematickou interpretaci těchto výsledků, poskytující informace o směrovosti jedno- a dvoufotonové absorpce v rámci molekul zkoumaných fluorescenčních proteinů. Pro anizotropii jenofotonové absorpce určujeme orientaci dipólových momentů přechodu ve třech reprezentativních fluorescenčních proteinech. Porovnání naměřených hodnot s dostupnými kvantově-mechanickými předpověďmi a experimentálně stanovenou orientací dipólového momentu přechodů GFP nám dává důvěru k získaným výsledkům. Pro dvoufotonovou absorpci nejprve testujeme naši hypotézu, že tenzory dvoufotonové absorptivity reprezentativních FP vykazují vektorové chování. Dále pak zkoumáme použitelnost tohoto zjednodušení jako základ pro interpretaci našich mikroskopických dat dvoufotonové polarizace.cs_CZ
uk.abstract.enFluorescent proteins (FPs) are the workhorses of biological molecular imaging. Important imaging modalities (such as polarization microscopy or FRET imaging) exploit anisotropic optical properties of fluorescent proteins. In this thesis, we present the results of our polarization microscopy and X-ray diffraction experiments on FP crystals, as well as mathematical interpretation of these results, yielding information on the directionality of one- and two-photon absorption within the investigated fluorescent protein molecules. For the anisotropy of one-photon absorption, we determine the transition dipole moment (TDM) orientations in three representative fluorescent proteins. Validation with available quantum mechanical predictions values and an experimentally determined TDM orientation of the GFP gives confidence to the results obtained. For the two-photon absorption, we first test our hypothesis that two-photon absorptivity tensors of representative FPs exhibit vector-like behaviour and then examine the applicability of this simplification as a basis for the interpretation of our two-photon polarization microscopy data.en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Matematicko-fyzikální fakulta, Fyzikální ústav UKcs_CZ
thesis.grade.code1
uk.publication-placePrahacs_CZ


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV