Studium elektronových přeskoků v systému heterocyklických molekul metodami kvantové mechaniky. Simulace absorpčních a emisních spekter.
Quantum mechanical study of the electron hopingp rocesses of heterocyclic molecules.Simulation of absorption and emission spectra.
bachelor thesis (DEFENDED)

View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/119765Identifiers
Study Information System: 221578
Collections
- Kvalifikační práce [11322]
Author
Advisor
Referee
Profant, Václav
Faculty / Institute
Faculty of Mathematics and Physics
Discipline
General Physics
Department
Department of Chemical Physics and Optics
Date of defense
14. 7. 2020
Publisher
Univerzita Karlova, Matematicko-fyzikální fakultaLanguage
Czech
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
Kvantová chemie, molekulová dynamika, semiempirické metodyKeywords (English)
Quantum chemistry, molecular dynamics, semiempirical methodsTato práce pojednává o výpočtu dob života excitovaných stavů molekul za použití semiempirických metod v simulacích kvantové molekulové dynamiky. Jako referenční molekuly byly zvoleny pyrimidinové nukleové báze a tři azaderiváty. Na těchto molekulách byly provedeny simulace molekulových dynamik v programu MNDO99 a byla spočtena jejich statická spektra v programech Gaussian a Orca. Všechny zkoumané molekuly vykazují femtosekundové doby života druhých excitovaných stavů, pyrimidinové báze vykazují krátké doby života i u prvních excitovaných stavů v řádu stovek femtosekund. Spočtené první excitované stavy azaderivátů dosahují desítek až stovek pikosekund a naznačují souvislost mezi stabilitou stavu a menším počtem aminoskupin navázaných na cyklu molekuly.
This thesis is about computing lifetimes of excited states of molecules by using semiempirical methods in simulations of molecular dynamics. Pyrimidine nucleobases and three aza- derivatives were chosen as reference molecules. Simulations of molecular dynamics by program MNDO99 were performed with these molecules and static spectra were computed by programs Gaussian and Orca. All the examined molecules have femtosecond lifetimes of second excited states, pyrimidine nucleobases have also short lifetimes of first excited states in hundreds of femtoseconds. The computed first excited states of aza-derivatives have lifetimes in tens or hundreds of picoseconds and suggest that the higher stability of the states is related to the smaller number of amino groups attached to the ring.