Show simple item record

Mezimolekulové vodíkové vazby studované pomocí NMR spektroskopie
dc.contributor.advisorDračínský, Martin
dc.creatorOsifová, Zuzana
dc.date.accessioned2020-08-04T09:48:30Z
dc.date.available2020-08-04T09:48:30Z
dc.date.issued2020
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/119751
dc.description.abstractN-methylation of nucleic acids is one of the most important epigenetic mechanisms in organisms and viruses and it is observed in connection with physiological or pathological processes in human body. For example, the N- methylation of adenine to give N6 -methyladenine is associated with development of obesity or Alzheimer disease. These systems can be successfully studied by low- temperature NMR spectroscopy because the bond between a purine ring and its substituent has a significant double-bond character and, due to restricted rotation around this bond, two sets of signals are observed in low-temperature NMR spectra. This diploma thesis is focused on research of N-methylated nucleobases' rotamer equilibria and the free-energy changes associated with the hydrogen-bonded base pair formation via simple and straightforward method based on NMR spectroscopy monitoring. We proved that the rotamer equilibria of N-methylated adenine derivatives are dependent on temperature, solvent and bonding partner concentration. We also obtained the geometry of formed intermolecular complexes of N-methylated adenine derivatives with thymine and the free-energy changes associated with their formations via newly developed method based on chemical shift changes dependent on bonding partner concentration. All obtained data...en_US
dc.description.abstractN-methylace nukleových kyselin je jeden z nejdůležitějších epigenetických mechanismů v genomech organismů a virů. N-methylované nukleobáze jsou v lidském genomu registrovány ve spojitosti s fyziologickými i patologickými procesy. Například methylace adeninu vedoucí ke vzniku N6 -methyladeninu je spojována s rozvojem Alzheimerovy nemoci či obezity. Tyto systémy mohou být snadno studovány pomocí nízkoteplotní NMR spektroskopie, protože řád vazby mezi purinovým kruhem a jeho substituentem má částečně charakter násobné vazby. Díky omezené rotaci kolem této vazby lze jednotlivé rotamery odlišit v nízkoteplotních NMR spektrech jako dvě sady signálů. Tato diplomová práce je zaměřena na výzkum rotamerních rovnováh N- methylovaných nukleobází a na výzkum změn volné Gibbsovy energie spojené se vznikem jejich páru s komplementárním partnerem za pomoci jednoduché a přímé metody NMR spektroskopie. Touto metodou jsme prokázali, že rotamerní rovnováhy N-methylovaných derivátů adeninu jsou závislé na teplotě, rozpouštědle a na koncentraci komplementárního partnera. S pomocí námi nově vyvinuté metodiky založené na pozorování změn chemických posunů závislých na koncentraci vazebného partnera jsme získali nejen geometrie vznikajících párů komplementárních derivátů adeninu s thyminem, ale i změny Gibbsovy energie...cs_CZ
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.titleIntermolecular Hydrogen Bonds Studied by NMR Spectroscopyen_US
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2020
dcterms.dateAccepted2020-07-07
dc.description.departmentDepartment of Organic Chemistryen_US
dc.description.departmentKatedra organické chemiecs_CZ
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.identifier.repId205901
dc.title.translatedMezimolekulové vodíkové vazby studované pomocí NMR spektroskopiecs_CZ
dc.contributor.refereeBlahut, Jan
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineOrganická chemiecs_CZ
thesis.degree.disciplineOrganic Chemistryen_US
thesis.degree.programChemistryen_US
thesis.degree.programChemiecs_CZ
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra organické chemiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Organic Chemistryen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csOrganická chemiecs_CZ
uk.degree-discipline.enOrganic Chemistryen_US
uk.degree-program.csChemiecs_CZ
uk.degree-program.enChemistryen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csN-methylace nukleových kyselin je jeden z nejdůležitějších epigenetických mechanismů v genomech organismů a virů. N-methylované nukleobáze jsou v lidském genomu registrovány ve spojitosti s fyziologickými i patologickými procesy. Například methylace adeninu vedoucí ke vzniku N6 -methyladeninu je spojována s rozvojem Alzheimerovy nemoci či obezity. Tyto systémy mohou být snadno studovány pomocí nízkoteplotní NMR spektroskopie, protože řád vazby mezi purinovým kruhem a jeho substituentem má částečně charakter násobné vazby. Díky omezené rotaci kolem této vazby lze jednotlivé rotamery odlišit v nízkoteplotních NMR spektrech jako dvě sady signálů. Tato diplomová práce je zaměřena na výzkum rotamerních rovnováh N- methylovaných nukleobází a na výzkum změn volné Gibbsovy energie spojené se vznikem jejich páru s komplementárním partnerem za pomoci jednoduché a přímé metody NMR spektroskopie. Touto metodou jsme prokázali, že rotamerní rovnováhy N-methylovaných derivátů adeninu jsou závislé na teplotě, rozpouštědle a na koncentraci komplementárního partnera. S pomocí námi nově vyvinuté metodiky založené na pozorování změn chemických posunů závislých na koncentraci vazebného partnera jsme získali nejen geometrie vznikajících párů komplementárních derivátů adeninu s thyminem, ale i změny Gibbsovy energie...cs_CZ
uk.abstract.enN-methylation of nucleic acids is one of the most important epigenetic mechanisms in organisms and viruses and it is observed in connection with physiological or pathological processes in human body. For example, the N- methylation of adenine to give N6 -methyladenine is associated with development of obesity or Alzheimer disease. These systems can be successfully studied by low- temperature NMR spectroscopy because the bond between a purine ring and its substituent has a significant double-bond character and, due to restricted rotation around this bond, two sets of signals are observed in low-temperature NMR spectra. This diploma thesis is focused on research of N-methylated nucleobases' rotamer equilibria and the free-energy changes associated with the hydrogen-bonded base pair formation via simple and straightforward method based on NMR spectroscopy monitoring. We proved that the rotamer equilibria of N-methylated adenine derivatives are dependent on temperature, solvent and bonding partner concentration. We also obtained the geometry of formed intermolecular complexes of N-methylated adenine derivatives with thymine and the free-energy changes associated with their formations via newly developed method based on chemical shift changes dependent on bonding partner concentration. All obtained data...en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra organické chemiecs_CZ
thesis.grade.code1
uk.publication-placePrahacs_CZ


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV