Dermatofyty izolované ze srsti volně žijících hlodavců
Dermatophytes isolated from the hair of free-living rodents
diplomová práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/119691Identifikátory
SIS: 173557
Kolekce
- Kvalifikační práce [19113]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Mašínová, Tereza
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Botanika
Katedra / ústav / klinika
Katedra botaniky
Datum obhajoby
13. 7. 2020
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Čeština
Známka
Výborně
Klíčová slova (česky)
Arthroderma, geofilní dermatofyty, izolace kmenů, keratinolýza, MAT geny, polyfázická taxonomie, vícegenová fylogenetická analýza, volně žijící hlodavciKlíčová slova (anglicky)
Arthroderma, geophilic dermatophytes, isolation of strains, keratinolysis, mating type genes, polyphasic taxonomy, multigene phylogenetic analysis, free-living rodentsDermatofyty (řád Onygenales, Ascomycota) jsou mikroskopické vláknité keratinofilní houby, které mohou způsobovat kožní infekce známé jako dermatofytózy. Nejdiverzifikovanější a zároveň nepříliš prozkoumaný rod Arthroderma prošel v nedávné době revizí (Míková 2018), která položila základy pro další výzkum. Tento rod zahrnuje zejména druhy s předpokládaným rezervoárem v půdě. Nedostatek informací o jejich ekologii a častá izolace některých druhů ze srsti volně žijících savců (především hlodavců) by však mohly vypovídat o silné vazbě na hostitele. Hlodavci by tak mohli představovat skrytý rezervoár těchto druhů. Pro účely této práce jsem vybrala tři ekologicky rozdílné druhy hlodavců: myš domácí, myšici lesní a norníka rudého. Izoláty jsem získala ze stěrů srsti asymptomatických jedinců, které jsem kultivovala na selektivním mediu. Získané kmeny (n = 30) jsem následně molekulárně identifikovala. Na základě tří vysoce variabilních úseků DNA (ITS, tubb a tef1α) jsem izoláty zařadila do fylogenetické analýzy vycházející z monografie rodu Arthroderma (Míková 2018). Dále jsem charakterizovala fenotyp vybraných izolátů s použitím morfologických a fyziologických dat včetně schopnosti rozkládat keratin a produkovat siderofory. U některých kmenů jsem na základě zjištěných MAT genů za pomoci nově navržených...
Dermatophytes (order Onygenales, Ascomycota) are microscopic filamentous keratinophilic fungi that can cause skin infections known as dermatophytosis. The most diverse but not very studied genus Arthroderma has been revised recently (Míková 2018) which was essential for further research. This genus comprises mostly species with a supposed reservoir in soil. Lack of information about their ecology and frequent isolation of some species from the hair of free- living mammals (mainly rodents) may testify a strong host association. Rodents could thus represent the hidden reservoir of this species. For this thesis, I have chosen three ecologically distinct rodent species: Mus musculus, Apodemus flavicollis, and Clethrionomys glareolus. I obtained the material by brushing the hair of asymptomatic individuals and used this material for cultivation on selective medium. I identified the isolates of dermatophytes (n = 30) using molecular methods. I used sequences of three highly variable loci (ITS, tubb a tef1α) to incorporate these isolates in the phylogenetic analysis based on the monography of the genus Arthroderma (Míková 2018). I characterized the phenotype of selected strains based on morphological and physiological data including the ability to utilize keratin and the production of siderophores. The...