Show simple item record

Selection and validation of reference genes for relative mRNA quantification in human liver slices
dc.contributor.advisorBoušová, Iva
dc.creatorStudenovská, Petra
dc.date.accessioned2020-06-24T09:59:16Z
dc.date.available2020-06-24T09:59:16Z
dc.date.issued2020
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/117429
dc.description.abstractCharles University Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Biochemical Sciences Candidate: Bc. Petra Studenovská Supervisor: doc. PharmDr. Boušová Iva, Ph.D. Title of diploma thesis: Selection and validation of reference genes for relative mRNA quantification in human liver slices The use of precision-cut liver slices is often employed in vitro system in the biochemical, pharmacological and toxicological studies. This is mainly due to the preservation of the cellular tissue architecture and therefore its functions. The aim of this diploma thesis was to select and validate reference genes for the relative quantification of mRNA in human liver slices. Liver tissues obtained from 3 patients of different age, diagnosis and pharmacotherapy were used as samples. Liver slices, prepared from samples of liver tissue, were exposed to dimethyl sulfoxide (control) or known inducers of cytochrome P450, rifampicin (10 µM) and β-naphthoflavone (10 µM). Subsequently, the stability of the expression of reference genes was verified using RefFinder program, which integrates the programs of the geNorm, BestKeeper, NormFinder and comparative ΔCT method. The optimal number of reference genes that should be used to evaluate the relative gene expression of target genes was determined using the geNorm program....en_US
dc.description.abstractUniverzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biochemických věd Kandidát: Bc. Petra Studenovská Školitel: doc. PharmDr. Boušová Iva, Ph.D. Název diplomové práce: Výběr a validace referenčních genů pro relativní kvantifikaci mRNA v lidských jaterních řezech Použití ultratenkých jaterních řezů je často využívaným in vitro systém při biochemických, farmakologických a toxikologických studiích. Důvodem je zejména zachování buněčné architektury tkáně, a tedy i jejích funkcí. Cílem diplomové práce byl výběr a validace referenčních genů pro relativní kvantifikaci mRNA v lidských jaterních řezech. Jako vzorky byla použita jaterní tkán od 3 pacientů s různým věkem, diagnózou a farmakoterapií. Ze vzorků jater byly připraveny jaterní řezy, které byly vystaveny působení dimethylsulfoxidu (kontrola) nebo známým induktorům cytochromu P450, rifampicinu (10 µM) a β-naftoflavonu (10 µM). Následně byla ověřena stabilita exprese referenčních genů pomocí programu RefFinder, který integruje programy geNorm, BestKeeper, NormFinder a komparativní ΔCT metodu. Optimální počet referenčních genů, které by měly být použity k relativnímu hodnocení genové exprese cílových genů, byl zjištěn pomocí programu geNorm. Nejvhodnější kombinací genů pro normalizaci exprese sledovaných genů byla dvojice YWHAZ a B2M....cs_CZ
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Královécs_CZ
dc.titleVýběr a validace referenčních genů pro relativní kvantifikaci mRNA v lidských jaterních řezechcs_CZ
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2020
dcterms.dateAccepted2020-06-03
dc.description.departmentKatedra biochemických vědcs_CZ
dc.description.departmentDepartment of Biochemical Sciencesen_US
dc.description.facultyFaculty of Pharmacy in Hradec Královéen_US
dc.description.facultyFarmaceutická fakulta v Hradci Královécs_CZ
dc.identifier.repId193966
dc.title.translatedSelection and validation of reference genes for relative mRNA quantification in human liver slicesen_US
dc.contributor.refereeMatoušková, Petra
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineSpecialist in Laboratory Methodsen_US
thesis.degree.disciplineOdborný pracovník v laboratorních metodáchcs_CZ
thesis.degree.programHealthcare bioanalyticsen_US
thesis.degree.programZdravotnická bioanalytikacs_CZ
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csFarmaceutická fakulta v Hradci Králové::Katedra biochemických vědcs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Pharmacy in Hradec Králové::Department of Biochemical Sciencesen_US
uk.faculty-name.csFarmaceutická fakulta v Hradci Královécs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Pharmacy in Hradec Královéen_US
uk.faculty-abbr.csFaFcs_CZ
uk.degree-discipline.csOdborný pracovník v laboratorních metodáchcs_CZ
uk.degree-discipline.enSpecialist in Laboratory Methodsen_US
uk.degree-program.csZdravotnická bioanalytikacs_CZ
uk.degree-program.enHealthcare bioanalyticsen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csUniverzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biochemických věd Kandidát: Bc. Petra Studenovská Školitel: doc. PharmDr. Boušová Iva, Ph.D. Název diplomové práce: Výběr a validace referenčních genů pro relativní kvantifikaci mRNA v lidských jaterních řezech Použití ultratenkých jaterních řezů je často využívaným in vitro systém při biochemických, farmakologických a toxikologických studiích. Důvodem je zejména zachování buněčné architektury tkáně, a tedy i jejích funkcí. Cílem diplomové práce byl výběr a validace referenčních genů pro relativní kvantifikaci mRNA v lidských jaterních řezech. Jako vzorky byla použita jaterní tkán od 3 pacientů s různým věkem, diagnózou a farmakoterapií. Ze vzorků jater byly připraveny jaterní řezy, které byly vystaveny působení dimethylsulfoxidu (kontrola) nebo známým induktorům cytochromu P450, rifampicinu (10 µM) a β-naftoflavonu (10 µM). Následně byla ověřena stabilita exprese referenčních genů pomocí programu RefFinder, který integruje programy geNorm, BestKeeper, NormFinder a komparativní ΔCT metodu. Optimální počet referenčních genů, které by měly být použity k relativnímu hodnocení genové exprese cílových genů, byl zjištěn pomocí programu geNorm. Nejvhodnější kombinací genů pro normalizaci exprese sledovaných genů byla dvojice YWHAZ a B2M....cs_CZ
uk.abstract.enCharles University Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Biochemical Sciences Candidate: Bc. Petra Studenovská Supervisor: doc. PharmDr. Boušová Iva, Ph.D. Title of diploma thesis: Selection and validation of reference genes for relative mRNA quantification in human liver slices The use of precision-cut liver slices is often employed in vitro system in the biochemical, pharmacological and toxicological studies. This is mainly due to the preservation of the cellular tissue architecture and therefore its functions. The aim of this diploma thesis was to select and validate reference genes for the relative quantification of mRNA in human liver slices. Liver tissues obtained from 3 patients of different age, diagnosis and pharmacotherapy were used as samples. Liver slices, prepared from samples of liver tissue, were exposed to dimethyl sulfoxide (control) or known inducers of cytochrome P450, rifampicin (10 µM) and β-naphthoflavone (10 µM). Subsequently, the stability of the expression of reference genes was verified using RefFinder program, which integrates the programs of the geNorm, BestKeeper, NormFinder and comparative ΔCT method. The optimal number of reference genes that should be used to evaluate the relative gene expression of target genes was determined using the geNorm program....en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové, Katedra biochemických vědcs_CZ
thesis.grade.code1
uk.publication-placeHradec Královécs_CZ


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV