Epigenetic Regulation of Adhesive Molecules in High-grade Serous Ovarian Carcinoma

Abstract

4 Souhrn Název: Epigenetická regulace adhezivních molekul u high-grade serózního ovariálního karcinomu Nedostatek účinných biomarkerů pro screening a včasnou detekci ovariálního karcinomu je v současné době považován za jeden z nejnaléhavějších problémů onkogynekologie. Vzhledem k tomu, že k epigenetickým změnám dochází již v počátcích karcinogeneze, mohly by být tyto změny využity jako screeningové markery u rizikové populace. Epigenetické mechanismy se mimo jiné podílejí i na regulaci adhezivních molekul, které sehrávají důležitou roli při rozvoji nádoru a tvorbě metastáz. Hlavním cílem této práce byla analýza změn v metylaci u vybraných kadherinů a kateninů v ovariální nádorové tkáni v porovnání s kontrolní tkání. Vyšetřovaný soubor tvořilo 68 pacientek s high-grade serózním ovariálním karcinomem (HGSOK) a 46 kontrolních pacientek. Pro stanovení oblastí s nejvýznamnějšími změnami v metylaci ve vybraných genech bylo využito masivně paralelního sekvenování. Pro potvrzení metylačních změn v místech s největším potenciálem byla použita metylačně-sensitivní vysokorozlišovací analýza křivek tání a metylačně-specifická kvantitativní polymerázová řetězová reakce. Dalším cílem práce bylo vytvoření panelu biomarkerů, který by mohl být v budoucnu využit při screeningu HGSOK. Vybrané kadheriny byly proto hodnoceny...

5 Summary Title: Epigenetic Regulation of Adhesive Molecules in High-grade Serous Ovarian Carcinoma The lack of effective biomarkers for screening and early detection of ovarian cancer is currently considered as one of the most pressing problems in oncogynecology. Because epigenetic alterations occur early in the cancer development, they provide great potential to serve as such biomarkers. Epigenetic mechanisms have been implicated also in regulation of adhesion molecules that play a major role in cancer progression. The main aim of this study was to investigate the methylation pattern of selected cadherin and catenin genes in ovarian cancer tissue by comparison with control tissue. The study group consisted of 68 patients with high-grade serous ovarian cancer (HGSOC) and 46 control patients. To determine the sites with the most significant methylation in selected genes next-generation sequencing was employed. For further confirmation of detected methylation of selected regions, methylation-sensitive high-resolution melting analysis and real-time methylation-specific polymerase chain reaction were used. In attempt to design potential biomarker panel for future screening of HGSOC as the secondary aim of our study, cadherins were evaluated together with transcription factors from our previous study....