Analýza pohlavných chromozómov a repetitívne usporiadaných génov u vybraných vtáčkarovitých a araneomorfných pavúkov
Analysis of sex chromosomes and gene clusters in selected mygalomorph and araneomorph spiders
Analýza pohlavných chromozómov a repetitívne usporiadaných génov u vybraných vtáčkarovitých a araneomorfných pavúkov
diploma thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/109927Identifiers
Study Information System: 173100
Collections
- Kvalifikační práce [20130]
Author
Advisor
Referee
Johnson Pokorná, Martina
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Genetics, Molecular Biology and Virology
Department
Department of Genetics and Microbiology
Date of defense
12. 9. 2019
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Slovak
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
araneomorph, chromozom, fluorescenční hybridizace in situ, karyotyp, komparativní genomová hybridizace, konstitutivní heterochromatin, mygalomorph, nukleolární organizátor, pavouk, pohlavní chromozom, repetitivně uspořádané genyKeywords (English)
araneomorph, chromosome, comparative genomic hybridization, constitutive heterochromatin, fluorescent in situ hybridization, gene cluster, karyotype, mygalomorph, nucleolus organizer region, sex chromosome, spider1 Abstrakt: Diplomová práca sa zaoberá evolúciou pohlavných chromozómov a repetitívne usporiadaných génov u vybraných vtáčkarovitých a araneomorfných pavúkov. Pavúky sa vyznačujú značnou zložitosťou systémov pohlavných chromozómov, ich karyotypy obsahujú viacero pohlavných chromozómov X. Okrem toho obsahujú tiež pár alebo dokonca dva páry nediferencovaných pohlavných chromozómov X a Y. Použité metódy zahrňujú metódy klasickej cytogenetiky (príprava chromozómových preparátov, C-pruhovanie) a molekulárnej cytogenetiky (fluorescenčná in situ hybridizácia a komparatívna genómová hybridizácia). U študovaných vtáčkarov boli odhalené zložité pohlavné systémy. U vtáčkarov Atropothele socotrana a Poecilotheria vittata sa jedná o neopohlavné chromozómy. Analýza molekulárnej diferenciácie pohlavných chromozómov naznačuje nízku diferenciáciu chromozómu Y u neopohlavných chromozómov a párov nediferencovaných pohlavných chromozómov XY. U haplogynného pavúka Kukulcania aff. hibernalis (X1X2Y) bol naopak Y značne diferencovaný, špecifický samčí signál pokrýval celý chromozóm. Detekce 18S rDNA ukázala, že karyotypy väčšiny analyzovaných vtáčkarov a haplogynných pavúkov obsahujú nízky počet (1 alebo 2) nukleolárnych organizátorov jadierka lokalizovaných terminálne, čo odpovedá predpokladanému ancestrálnemu stavu u pavúkov. U...
1 Abstract: The diploma thesis focuses on study of sex chromosomes evolution and repetitive organized genes of chosen mygalomorph and araneomorph spiders. Spiders are characterized by complexicity of sex chromosome systems, their karyotypes contain multiple sex chromosomes X. Besides multiple X chromosomes they also contain a pair or two pairs of nondiferentiated sex chromosomes X and Y. The used methods include methods of classical cytogenetics (preparation of chromosome slides, C-banding) and methods of molecular cytogenetics (fluorescent in situ hybridization and comparative genome hybridization). Complex sex systems were discovered in the studied Theraphosidae spiders. In Theraphosidae spiders Atropothele socotrana and Poecilotheria vittata neo-sex chromosomes were found. Analysis of molecular differentiation of sex chromosomes suggests low differentiation of Y chromosome in neo-sex chromosomes and pair of nondifferentiated sex chromosomes XY. In haplogyne spider Kukulcania aff. hibernalis (X1X2Y), the Y chromosome was significantly differentiated, male specific signal covered the whole chromosome. Detection of 18S rDNA showed that karyotypes of majority of analysed Theraphosidae spiders and haplogyne spiders contain low number (1 or 2) of nucleolar organizing regions localized terminally, which...