The expression of miRNA in HPV-associated and HPV-independent head and neck tumors

Abstract

Nádory hlavy a krku představují skupinu nádorů dvojí etiologie. První skupinou jsou nádory asociované s infekcí HPV, druhou skupinou jsou nádory nevirové etiologie, které jsou spojeny s dvěma hlavními rizikovými faktory, a tím je kouření a konzumace alkoholu. Z publikovaných studií je zřejmé, že HPV-pozitivní nádory se vyskytují častěji u mladších pacientů a zároveň tito pacienti vykazují lepší prognózu a celkové přežívání. Z tohoto důvodu je zvažována modifikace léčby na základě etiologie nádorového onemocnění. Nicméně je důležité zajistit specifický, citlivý a klinicky významný biomarker pro přesné určení etiologie nádoru. Vhodným kandidátem pro takové biomarkery jsou miRNAs, jakožto malé nekódující regulační molekuly, které jsou stabilní i v archivních vzorcích, a jejichž rozdílná exprese byla detekována v řadě lidských nádorů a je specifická pro nádory různého původu. Předkládaná práce je zaměřena na miRNA profilování v HPV-pozitivních a HPV-negativních nádorech krčních mandlí a nádorech děložního hrdla s cílem najít rozdíly v regulaci důležitých karcerogenních drah nádorů virové a nevirové etiologie. Naše výsledky ukazují velkou heterogenitu v expresních profilech miRNAs u těchto nádorů. I přes využití velmi dobře charakterizovaného a jednotného souboru vzorků jsme detekovali malý překryv...

Head and neck cancers represent a group of tumors with two different etiologies. The first type is associated with the viral HPV infection, the second one is virus-independent and it is associated with smoking and alcohol consumption as two main risk factors. Numerous studies show that HPV-positive tumors are more frequent in younger patients, as well as that the prognosis and overall survival of these patients is remarkably better. Therefore, the modification of the treatment is considered. For this, however, specific, sensitive and clinically relevant biomarkers for accurate identification of tumor etiology is needed. Suitable candidates for such biomarkers are miRNAs, small non-coding regulatory molecules stable in archived samples, that have been shown as differentially expressed in human cancers and the expression pattern seems specific for tumors of different origin. The submitted thesis focuses on miRNA profiling in HPV-positive and HPV-negative tonsillar tumors and cervical carcinomas with the aim to find out the differences between regulation of important carcinogenetic pathways of tumors of viral and non-viral etiology. Our data have shown very large heterogeneity of the miRNA expression profiles of these tumors. Despite the well characterized and uniform samples collection, we have found...