Functional characterization of LACE1 APTase and mitochondrial AAA proteases YME1L and AFG3L2 in mitochondrial protein homeostasis.
Funkční charakterizace LACE1 ATPázy a mitochondriálních AAA proteáz YME1L a AFG3L2 v mitochondriální proteinové homeostáze.
dizertační práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/105055Identifikátory
SIS: 153723
Kolekce
- Kvalifikační práce [4323]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Kalous, Martin
Pecina, Petr
Fakulta / součást
1. lékařská fakulta
Obor
-
Katedra / ústav / klinika
Klinika pediatrie a dědičných poruch metabolismu 1. LF UK a VFN
Datum obhajoby
30. 1. 2019
Nakladatel
Univerzita Karlova, 1. lékařská fakultaJazyk
Angličtina
Známka
Prospěl/a
Klíčová slova (česky)
Klíčová slova: apoptóza, dýchací řetězec, komplex IV, mitochondrie, oxidativní fosforylace, proteáza AFG3L2, proteáza YME1L, protein LACE1, tumor-supresorový protein p53, translokaceKlíčová slova (anglicky)
Key words: AFG3L2 protease, apoptosis, complex IV, LACE1 protein, mitochondria, oxidative phosphorylation, p53 tumor suppressor protein, respiratory chain, translocation, YME1L proteaseUdržení mitochondriální proteinové homeostázy je nezbytnou podmínkou pro průběh klíčových buněčných procesů a udržení buněčné integrity. Je zajištěna mnoha specifickými mitochondriálními proteázami s možnými chaperonovými funkcemi aktivních v různých mitochondriálních subkompartmentech. V první části této disertační práce jsme se zaměřili na charakterizaci funkčního překrývání a spolupráce proteolytických podjednotek AFG3L2 a YME1L mitochondriálních komplexů m-a i- AAA lokalizovaných ve vnitřní mitochondriální membráně. Dvojitě utišená buněčná linie AFG3L2/YME1L vykazovala výraznou změnu ve zpracování isoforem OPA1, výrazné zvýšení proteázy OMA1 a snížení proteinu SPG7. Naše výsledky ukazují spolupráci a částečně i nadbytečné funkční překrývání proteáz AFG3L2 a YME1L v udržení mitochondriální proteinové homeostázy, a dále podtrhují jejich důležitost pro mitochondriální a buněčné funkce a integritu. Cílem druhé části bylo charakterizovat buněčnou funkci proteinu LACE1 v mitochondriální proteinové homeostáze. Protein LACE1 je lidský homolog kvasinkové ATPázy Afg1. Z našich výsledků vyplývá, že LACE1 je mitochondriální integrální membránový protein, který existuje jako součást tří komplexů o přibližné molekulové hmotnosti 140, 400 a 500 kDa a zprostředkovává degradaci jaderně kódovaných podjednotek...
Mitochondrial protein homeostasis is crucial for cellular function and integrity. It is ensured by many specific mitochondrial proteases with possible chaperone functions located across the various mitochondrial subcompartments. In the first part, we have focused on characterization of functional overlap and cooperativity of proteolytic subunits AFG3L2 and YME1L of the mitochondrial inner membrane complexes m- and i-AAA in HEK293 cells. The double AFG3L2/YME1L knockdown cells showed severe alteration in OPA1 protein processing, marked elevation in OMA1 protease and severe reduction in SPG7. Our results reveal cooperative and partly redundant involvement of AFG3L2 and YME1L in the maintenance of mitochondrial protein homeostasis and further emphasize their importance for mitochondrial and cellular function and integrity. The aim of the second part was to characterize the cellular function of LACE1 (lactation elevated 1) in mitochondrial protein homeostasis. LACE1 protein is a human homologue of yeast Afg1 (ATPase family gene 1) ATPase. We show that LACE1 is a mitochondrial integral membrane protein that exists as a part of three complexes of approximately 140, 400 and 500 kDa. We demonstrate that LACE1 mediates degradation of nuclear-encoded complex IV subunits COX4, COX5A and COX6A. Using affinity...
Citace dokumentu
Metadata
Zobrazit celý záznamSouvisející záznamy
Zobrazují se záznamy příbuzné na základě názvu, autora a předmětu.
-
Applications of graph theory in protein function prediction
Výsledek obhajoby: OBHÁJENOKalábová, Nikola (Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2021)Datum obhajoby: 8. 6. 2021Rapidní vývoj celogenomových sekvenačních metod a jejich snižující se cena za- příčinila existenci velkého množství osekvenovaných genomů. Vývoj spolehlivých in-silico metod pro anotaci rychle rostoucího počtu osekvenovaných ... -
Funkční studie potenciální nukleotidázy kódované genem spr1057 Streptococcus pneumoniae, homologa proteinu YjjG E. coli
Výsledek obhajoby: OBHÁJENOVacková, Zuzana (Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2010)Datum obhajoby: 31. 5. 2010ČESKÝ ABSTRAKT Funkční studie potenciální nukleotidasy kódované genem spr1057 v Streptococcus pneumoniae, homologa proteinu YjjG Escherichia coli. Bakteriální buňky jsou neustále vystavovány nespočetným toxickým látkám, ... -
Role of the ubiquitin-like protein, Hub1, in the pre-mRNA splicing regulation
Výsledek obhajoby: OBHÁJENOHubáčková, Tereza (Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2018)Datum obhajoby: 4. 6. 2018Splicing is a key step of eukaryotic gene expression and as well as other steps of this vital process, splicing has to be tightly regulated. Hub1 protein is a ubiquitin-like protein which noncovalently interacts with ...