Vliv rostlin na strukturu, funkci a diverzitu společenstev bakterií

Abstract

Je známo, že složení vegetace může mít vliv na složení společenstev bakterií. V ekosystému mají bakterie mnoho funkcí, působí jako symbionti kořenů, podílejí se také na rozkladu rostlinné biomasy. Dále mohou být ovlivněny půdní chemií, ale také rostlinnými exsudáty. Některé rostliny produkují cílené exsudáty, které přitahují specifické bakterie na jejich kořeny. Bakterie s rostlinami často asociují, ale vliv rostlin na diverzitu a složení bakteriálních společenstev je stále nedostatečně prozkoumaný. Cílem této práce bylo popsat vztah mezi diverzitou a složením společenstev bakterií a diverzitou vegetace v lučním a lesním ekosystému a identifikovat další faktory, které bakteriální společenstva ovlivňují. Jako studijní oblasti byly vybrány plochy s gradientem diverzity vegetace v NPR Čertoryje a NP Šumava. Předpokládala jsem, že diverzita bakteriálních společenstev se zvyšuje s rostoucí diverzitou rostlin. Složení bakteriálních společenstev bylo charakterizováno sekvenováním 16S rRNA. Složení vegetace bylo určeno pomocí botanických snímků i pomocí molekulárních markerů trnL. V lučním ekosystému existoval pozitivní vztah mezi rostlinnou a bakteriální diverzitou pouze v nadzemních částech rostlin. V nadzemních částech rostlin bylo složení bakteriálního společenstva nejvíce ovlivněno faktorem prostoru a...

Vegetation is known to influence the composition of microbial communities. Bacteria can act as roots symbionts or be involved in the decomposition of plant biomass. They can be influenced by soil chemistry but also by plant exudates. Some plants produce targeted exudates to attract specific bacteria to their roots. Bacteria associate with plants frequently but the effect of plant diversity on bacterial communities on their roots and in the surrounding soil remains unclear. The aim of this work was to describe the relationship between the diversity and community composition of bacteria and the diversity of vegetation in forest and grassland ecosystems. The study areas were selected to represent a gradient of vegetation in Bohemian Forest NP and in White Carpathian flowery grasslands. I hypothesized that the diversity and evenness of bacterial community increase with increasing plant diversity. The composition of bacterial community was characterized by 16S rRNA sequencing. The composition of vegetation was determined by phytocenological relevées and by molecular markers trnL. In grassland ecosystem, there was a positive relationship between plant and bacterial diversity only in shoots. The space and vegetation were identified as an important drivers of bacterial community composition in shoots. The...