Phylogeography and population structure of two loach species (Teleostei: Nemacheilidae) in Southeast Asia
Fylogeografie a populační struktura dvou druhů mřenkovitých ryb (Teleostei: Nemacheilidae) z jihovýchodní Asie
diploma thesis (DEFENDED)

View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/102067Identifiers
Study Information System: 185690
Collections
- Kvalifikační práce [20314]
Author
Advisor
Consultant
Musilová, Zuzana
Referee
Říčan, Oldřich
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Zoology
Department
Department of Zoology
Date of defense
12. 9. 2018
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
English
Grade
Good
Keywords (Czech)
Paracanthocobitis, Schistura, Nemacheilidae, Biogeografie, Jihovýchodní Asie, Geologie, Izolované linie, Morfometrie, Kolonizace, BariéryKeywords (English)
Paracanthocobitis, Schistura, Nemacheilidae, Biogeography, Southeast Asia, Geology, Global sea water fluctuation, Morphometry, Colonisation, BariersSladkovodní druhy ryb ze skupin Schistura robertsi a Paracanthocobitis zonalternans patří do čeledi Nemacheilidae. Nemacheilidae jsou rozšířeni po celé Eurasii a jeden druh obývá severovýchodní Afriku. Paracanthocobitis zonalternans žije v nížinném prostředí západní části jihovýchodní Asie od centrální Barmy po severní část Malajsie. Areál rozšíření je z biogeografického pohledu velmi zajímavý, protože prochází řadou biogeografických bariér, jmenovitě hranicí mezi Indickou a Indočínskou faunou podél řeky Salween, Krajskou šíjí, linií Surat thani - Krabi a linií Kangar - Patani. K této studii bylo za použití genetických (mitochondriální a jaderné sekvence), morfologických a geologických dat, využito přibližně 250 jedinců z 62 lokalit pokrývajících celý areál rozšíření Genetická data z analyzovaného materiálu ukázala sedm hlavních linií odrážejících biogeografii areálu, s minimálním výskytem překryvu, ale s několika výskyty druhotného kontaktu. Datování událostí ukázalo, že P. zonalternans vznikl před 18 ml a biogeografické analýzy ukázaly, že se tak stalo v oblasti Tenasserim (jižní Barma). Změny hladiny světového oceánu měly velký vliv na formování zmiňovaných genetických linií. U jedné z linií, která již ve fylogenetických analýzách byla výrazně vzdálená ostatním, podpořily morfologické analýzy...
The freshwater fish species Schistura robertsi and Paracanthocobitis zonalternans belong to the family Nemacheilidae, which is distributed across whole Eurasia and with one species in northeast Africa. P. zonalternans occurs in lowland habitats through western Southeast Asia from Central Myanmar until northern Malaysia. The distribution area is of biogeographic interest, because it crosses several known biogeographic barriers, namely the border between Indian and Indochinese freshwater fauna along the Salween River, the Isthmus of Kra, the Krabi - Surat Thani line and the Kangar - Pattani line. In the present study, around 250 specimens of P. zonalternans from 62 localities across the whole distribution area were investigated using genetic (nuclear and mitochondrial sequences), morphologic and geologic data. The genetic data reveal the existence of seven major clades within the analysed material, each of them with a distinct geographic distribution area and only few cases of overlap, but with occurrence of some cases of secondary contact. Divergence time estimations suggested that P. zonalternans is about 18 my old, and a biogeographic analysis located the region of origin in the Tenasserim region (nowadays southern Myanmar). The global sea level fluctuations seem to have had a strong impact on the...