Molekulárně genetická analýza syndromu fragilního chromozomu X a myotonické /dystrofie

Abstract

SHRNUTÍ Práce je zaměřena na tři závažné choroby podmíněné jedinečným mutačním mechanismem - expanzí krátkých tandemových repetic. Syndrom fragilního chromozómu X je nejčastější příčinou X-vázané mentální retardace. Myotonické dystrofie typu 1 a 2 jsou nejčastějšími muskulárními dystrofiemi u dospělých. Práce shrnuje poznatky získané na velkých souborech pacientů shromážděných v rámci rutinní DNA diagnostiky těchto chorob. Byla zavedena široká paleta metod pro co nejrychlejší a nejpřesnější detekci expanzí, zejména rychlá fluorescenční PCR, TP-PCR a RP-PCR. Jako alternativní a doplňující metoda je stále využíván Southernův blot. Na základě získaných zkušeností a doporučení EMQN byl navržen optimální diagnostický protokol spočívající na promyšlené kombinaci těchto metod. Záchyt syndromu fragilního chromozómu X v souboru 1880 pacientů a jejich příbuzných indikovaných na testování FXS byl 4,5%. Ve shodě s literaturou byly pozorovány typické zákonitosti intergeneračního přenosu alel genu FMR1. Jedna pacientka s plným projevem FXS měla přednostní inaktivaci druhého chromozómu X postiženého intersticiální delecí. U dvou pacientů s FXS byly popsány zvláštní koincidence s karyotypem 47,XYY. V rodinách s FXS byl identifikován jeden pacient s jistým a jedna pacientka s možným onemocněním FXTAS. Další pacient byl...

This work focuses on three serious diseases caused by a unique mutational mechanism - the expansion of short tandem repeats. Fragile X syndrome is the most common cause of X- linked intellectual disability. Myotonic dystrophies type 1 and 2 are the most common muscular dystrophies in adults. The study summarizes findings obtained from large cohorts of patients collected as part of routine DNA diagnostics of these diseases. A wide range of methods was introduced to enable the fastest and most accurate detection of repeat expansions, especially rapid fluorescent PCR, TP-PCR, and RP-PCR. Southern blotting is still used as an alternative and complementary method. Based on the acquired experience and EMQN recommendations, an optimal diagnostic protocol was proposed, based on a thoughtful combination of these methods.The detection rate of Fragile X syndrome in a cohort of 1,880 patients and their relatives referred for FXS testing was 4.5%. In agreement with the literature, typical patterns of intergenerational transmission of FMR1 gene alleles were observed. One patient with a full manifestation of FXS had preferential inactivation of the second X chromosome affected by an interstitial deletion. In two patients with FXS, unusual coincidences with a 47,XYY karyotype were described. In families with FXS,...