Změny střevního mikrobiomu v souvislosti s transplantací stolice

Abstract

Introduction. The gut microbiota significantly influences host physiology. Dysbiosis, a condition with disturbed microbial balance, has been repeatedly described to be associated with a variety of diseases. One option to actively influence the composition of the gut microbiota is fecal microbial transplantation (FMT), which is the recommended treatment for recurrent Clostridioides difficile infection according to Czech and international guidelines. Nowadays, however, FMT is also the subject of research in the treatment and prevention of many other diseases. The lack of strictly organised clinical trials and the absence of a clearly defined protocol, including the definition of the optimal composition of the FMT filtrate, prevent the wider use of this method. Objectives. The aim of the present study is to propose a protocol for a clinical trial aimed at evaluating the efficacy, feasibility and safety of FMT in the treatment and prevention of recurrence of postantibiotic diarrhea in critically ill patients compared to standard treatment. Furthermore, the work focuses on the quality of material for FMT, namely (i) the evaluation of the effect of the length of freezing of stool filtrate on bacterial viability and (ii) the development of a methodology for routine viability determination applicable in routine...

Úvod. Střevní mikrobiota výrazným způsobem ovlivňuje fyziologii hostitele. Opakovaně bylo popsáno, že dysbióza, stav s narušenou mikrobiální rovnováhou, je asociována s řadou onemocnění. Jednou z možností, jak aktivně ovlivnit složení střevní mikrobioty, je fekální mikrobiální transplantace (FMT), která je dle českých i zahraničních guidelines doporučenou léčbou u recidivující infekce Clostridioides difficile. V dnešní době je však FMT předmětem výzkumu i při léčbě a prevenci řady jiných chorob. Nedostatek přísně organizovaných klinických studií a absence jasně stanoveného protokolu, včetně definice optimálního složení FMT filtrátu, brání širšímu využití této metody. Cíle. Cílem předkládané práce je navrhnout protokol klinické studie zaměřené na hodnocení účinnosti, proveditelnosti a bezpečnosti metody fekální mikrobiální transplantace (FMT) při léčbě a prevenci recidivy postantibiotického průjmu u kriticky nemocných pacientů, ve srovnání se standardní léčbou. Dále se práce soustřeďuje na problematiku kvality materiálu pro FMT, a to (i) hodnocení vlivu délky zamražení filtrátu stolice na viabilitu bakterií a (ii) vypracování metodiky pro rutinní stanovení viability použitelné v běžné klinické praxi. Metodologie. Protokol prospektivní, multicentrické, randomizované, otevřené, kontrolované studie byl...