Show simple item record

Optimization of mobile phase composition for analysis of peptides in mixed-mode chromatography
dc.contributor.advisorLenčo, Juraj
dc.creatorTužil, Ondřej
dc.date.accessioned2021-10-08T08:11:39Z
dc.date.available2021-10-08T08:11:39Z
dc.date.issued2021
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/150576
dc.description.abstractFarmaceutická Fakulta v Hradci Králové, Univerzita Karlova Katerdra Analytické chemie Kandidát: Ondřej Tužil Školitel: PharmDr. Juraj Lenčo Ph.D. Název diplomové práce: Optimalizace složení mobilních fází pro analýzu peptidů vícemodální chromatografií Při bottom-up proteomických analýzách prováděných pomocí kapalinové chromatografie s hmotnostní detekcí se mobilní fáze okyseluje slabými kyselinami, které intenzitu analytů při detekci netlumí v takové míře jako běžně používané kyseliny pro separace bez hmotnostní detekce. Takovým aditivem mobilní fáze je kyselina mravenčí, která je nejběžněji používaná v koncentraci 0,1 % (v/v). Tato práce byla zaměřena na hledání nejnižší možné koncentrace kyseliny mravenčí, která by v kombinaci s vícemodální stacionární fází kolony ACQUITY UPLC CSH C18 od firmy Waters stále zajišťovala účinnou separaci peptidů, přičemž by se zároveň mělo dosáhnout zvýšení odezvy v hmotnostním spektrometru. Nejprve byly provedeny separace standardů peptidů na kapalinové chromatografii s UV detekcí s klesajícím množstvím kyseliny mravenčí v mobilní fázi. Bylo zjištěno, že pro vyhovující parametry separace peptidů je možné použít výrazně nižší koncentrace kyseliny mravenčí. Tři nejnižší koncentrační hladiny byly použity k analýzám s hmotnostní detekcí, kde byl skutečně pozorován...cs_CZ
dc.description.abstractFaculty of Pharmacy in Hradec Králové, Charles University Department of Analytical Chemistry Candidate: Ondřej Tužil Supervisor: PharmDr. Juraj Lenčo Ph.D. Title: Optimization of mobile phase composition for analysis of peptides in mixed-mode chromatography In bottom-up proteomic analyzes performed by liquid chromatography with mass detection, the mobile phase is acidified with weak acids, which do not suppress the intensity of the analytes in the detection to the same extent as commonly used acids for separations without mass detection. Such a mobile phase additive is formic acid, which is most commonly used at a concentration of 0.1 % (v / v). This work was focused on finding the lowest possible concentration of formic acid, which in combination with the multimodal stationary phase of the ACQUITY UPLC CSH C18 column from Waters would still ensure efficient separation of peptides, while increasing the response in the mass spectrometer. First, separations of peptide standards were performed by liquid chromatography with UV detection with decreasing amounts of formic acid in the mobile phase. It has been found that significantly lower concentrations of formic acid can be used for satisfactory peptide separation parameters. The three lowest concentration levels were used for mass detection analyzes,...en_US
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Královécs_CZ
dc.titleOptimalizace složení mobilních fází pro analýzu peptidů vícemodální chromatografiícs_CZ
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2021
dcterms.dateAccepted2021-09-16
dc.description.departmentDepartment of Analytical Chemistryen_US
dc.description.departmentKatedra analytické chemiecs_CZ
dc.description.facultyFarmaceutická fakulta v Hradci Královécs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Pharmacy in Hradec Královéen_US
dc.identifier.repId206651
dc.title.translatedOptimization of mobile phase composition for analysis of peptides in mixed-mode chromatographyen_US
dc.contributor.refereeŘehulka, Pavel
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelmagisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplinePharmacyen_US
thesis.degree.disciplineFarmaciecs_CZ
thesis.degree.programFarmaciecs_CZ
thesis.degree.programPharmacyen_US
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csFarmaceutická fakulta v Hradci Králové::Katedra analytické chemiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Pharmacy in Hradec Králové::Department of Analytical Chemistryen_US
uk.faculty-name.csFarmaceutická fakulta v Hradci Královécs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Pharmacy in Hradec Královéen_US
uk.faculty-abbr.csFaFcs_CZ
uk.degree-discipline.csFarmaciecs_CZ
uk.degree-discipline.enPharmacyen_US
uk.degree-program.csFarmaciecs_CZ
uk.degree-program.enPharmacyen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csFarmaceutická Fakulta v Hradci Králové, Univerzita Karlova Katerdra Analytické chemie Kandidát: Ondřej Tužil Školitel: PharmDr. Juraj Lenčo Ph.D. Název diplomové práce: Optimalizace složení mobilních fází pro analýzu peptidů vícemodální chromatografií Při bottom-up proteomických analýzách prováděných pomocí kapalinové chromatografie s hmotnostní detekcí se mobilní fáze okyseluje slabými kyselinami, které intenzitu analytů při detekci netlumí v takové míře jako běžně používané kyseliny pro separace bez hmotnostní detekce. Takovým aditivem mobilní fáze je kyselina mravenčí, která je nejběžněji používaná v koncentraci 0,1 % (v/v). Tato práce byla zaměřena na hledání nejnižší možné koncentrace kyseliny mravenčí, která by v kombinaci s vícemodální stacionární fází kolony ACQUITY UPLC CSH C18 od firmy Waters stále zajišťovala účinnou separaci peptidů, přičemž by se zároveň mělo dosáhnout zvýšení odezvy v hmotnostním spektrometru. Nejprve byly provedeny separace standardů peptidů na kapalinové chromatografii s UV detekcí s klesajícím množstvím kyseliny mravenčí v mobilní fázi. Bylo zjištěno, že pro vyhovující parametry separace peptidů je možné použít výrazně nižší koncentrace kyseliny mravenčí. Tři nejnižší koncentrační hladiny byly použity k analýzám s hmotnostní detekcí, kde byl skutečně pozorován...cs_CZ
uk.abstract.enFaculty of Pharmacy in Hradec Králové, Charles University Department of Analytical Chemistry Candidate: Ondřej Tužil Supervisor: PharmDr. Juraj Lenčo Ph.D. Title: Optimization of mobile phase composition for analysis of peptides in mixed-mode chromatography In bottom-up proteomic analyzes performed by liquid chromatography with mass detection, the mobile phase is acidified with weak acids, which do not suppress the intensity of the analytes in the detection to the same extent as commonly used acids for separations without mass detection. Such a mobile phase additive is formic acid, which is most commonly used at a concentration of 0.1 % (v / v). This work was focused on finding the lowest possible concentration of formic acid, which in combination with the multimodal stationary phase of the ACQUITY UPLC CSH C18 column from Waters would still ensure efficient separation of peptides, while increasing the response in the mass spectrometer. First, separations of peptide standards were performed by liquid chromatography with UV detection with decreasing amounts of formic acid in the mobile phase. It has been found that significantly lower concentrations of formic acid can be used for satisfactory peptide separation parameters. The three lowest concentration levels were used for mass detection analyzes,...en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové, Katedra analytické chemiecs_CZ
thesis.grade.code1
uk.publication-placeHradec Královécs_CZ
uk.thesis.defenceStatusO


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV