Location and translocation of CTCF in distinct cell lines

Abstract

Location and translocation in distinct cell lines CCCTC-binding factor (CTCF) is a versatile zinc finger protein with diverse regulatory functions such as cell growth, differentiation, apoptosis, enhancer-blocking activity and control of imprinted genes. The present work is aimed to clarify the contribution of poly(ADP-ribosylation) in CTCF regulation. CTCF is expressed in various isoforms, with two prominent bands at 130 kDa and 180 kDa in Raji, ARO, NPA and HeLa tumour cells untreated or treated with sodium butyrate. In particular, the latter band at 180 kDa represents a poly(ADP-ribosyl)ated isoform of CTCF which is significantly evident in all treated tumour cell lines. CTCF is usually localized in the nucleus and its subcellular distribution during the cell cycle is dynamic. Redistribution of CTCF in the nucleus may be important to trigger and sustain necessary metabolic changes leading to cell growth arrest and, further, to terminal differentiation and apoptosis. We demonstrated that CTCF was present all over the nuclei in untreated Raji cells, whereas CTCF is also concentrated in the nucleoli in treated ones. Translocation of CTCF was not evidenced in treated thyroid tumour and HeLa cells and was distributed in the cytosol, predominantly concentrated at the nuclear periphery in both...

Lokace a translokace CTCF v různých buněčných liniích CCCTC-vazebný faktor (CTCF) je polyfunkční protein s doménou zinkového prstu. Svými rozličnými regulačními funkcemi zasahuje do regulace buněčného růstu, diferenciace a apoptózy, má aktivitu blokující funkci funkci zesilovačů a kontroly imprintovaných genů. Tato práce kladla za cíl objasnit příspěvek poly(ADP- ribosyl)ace v regulaci CTCF. V buňkách ARO, NPA, Raji a HeLa inkubovaných za kontrolních podmínek a s butyrátem sodným jsme zjistili expresi CTCF v různých isoformách se dvěma významnými proužky o velikosti 130 kDa a 180 kDa. Zejména druhý zmiňovaný proužek v 180 kDa představuje poly(ADP-ribosyl)ovanou isoformu CTCF, která je zvláště patrná ve všech buňkách vystavených butyrátu sodnému. CTCF je obvykle lokalizován v jádře a jeho subcelulární distribuce během buněčného cyklu je dynamická. Redistribuce CTCF v jádře může být důležitá pro spuštění a udržení potřebných metabolických změn vedoucích k zastavení buněčného růstu, terminální diferenciaci a apoptóze. V této práci jsme prokázali, že u neovlivněných Raji buněk je CTCF přítomný v jádře, zatímco u ovlivněných butyrátem sodným je koncentrován také v jadérku. Translokace CTCF nebyla prokázána u kontrolních tyroidních nádorových a HeLa buněk, byl zde distribuován v cytosolu, u kontrolních a...