Molekulárne genetické vyšetrenie klonálnych prestavieb u B a T lymfocytov pri podozrení na lymfoproliferatívne ochorenie v diagnostickom laboratóriu

Abstract

Charles University Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Biochemical Sciences Candidate: Bc. Iveta Kasáková Supervisor: prof. PharmDr. Tomáš Šimůnek, Ph.D Consultant: Mgr. Radek Měch Title of diploma thesis: Molecular genetic testing of clonal rearrangements in B and T lymphocyte suspected of lymphoproliferative disease in diagnostic laboratory The diploma thesis deals in detail with the development of B and T lymphocytes, the process of V(D)J recombination during reconstruction and an overview of diseases of the lymphatic system. The aim of the diploma thesis was to introduce and optimize the examination of clonal rearrangement of immunoglobulins and T cell receptor using polymerase chain reaction (PCR) followed by detection using fragmentation analysis. The practical part of the work was focused on the investigation of monoclonal rearrangement in 69 samples admitted to the laboratory of molecular genetics in the years 2018-2020. Most of them were tissue samples from paraffin-embedded biopsies (FFPE, formalin fixed, paraffin-embedded tissue), to a lesser extent peripheral blood samples and one sample was from bone marrow. Monoclonal rearrangements were detected in 29 (48,33%) of immunoglobulins and 23 (47,92%) of T cell receptor rearrangements in examined samples. Sanger sequencing...

Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biochemických vied Kandidát: Bc. Iveta Kasáková Školiteľ: prof. PharmDr. Tomáš Šimůnek, Ph.D Konzultant: Mgr. Radek Měch Názov diplomové práce: Molekulárne genetické vyšetrenie klonálnych prestavieb u B a T lymfocytov pri podozrení na lymfoproliferatívne ochorenie v diagnostickom laboratóriu V diplomovej práci je podrobne spracovaný vývoj B a T lymfocytov, priebeh V(D)J rekombinácie pri prestavbe a prehľad ochorení lymfatického systému. Cieľom diplomovej práce bolo zavedenie a optimalizácia vyšetrenia klonálnej prestavby imunoglobulínov a T- bunkového receptoru pomocou polymerázovej reťazovej reakcie (PCR) s následnou detekciou pomocou fragmentačnej analýzy. Praktická časť práce bola zameraná na vyšetrenie monoklonálnej prestavby u 69 vzoriek prijatých do laboratória molekulárnej genetiky v rokoch 2018-2020. Vo veľkej časti sa jednalo o vzorky tkanív z biopsií zaliate v parafíne (FFPE, formalin fixed, paraffin-embedded tissue), v menšom počte o vzorky periférnej krvi a jedna vzorka bola z kostnej drene. Monoklonálne prestavby bolí zachytené u 29 (48,33%) imunoglobulínov a 23 (47,92%) prestavieb T bunkového receptoru vyšetrených vzoriek. U 26 vzoriek, u ktorých bola detekovaná monoklonálna prestavba v IgH, bolo prevedené sekvenovanie...