The role of Hepatitis B virus capsid protein in the host ubiquitin proteasome pathway
Role kapsidového proteinu virové hepatitidy B v hostitelském ubikvitin-proteazomovém systému
diplomová práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/98134Identifikátory
SIS: 185335
Kolekce
- Kvalifikační práce [19109]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Šmahel, Michal
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Genetika, molekulární biologie a virologie
Katedra / ústav / klinika
Katedra genetiky a mikrobiologie
Datum obhajoby
31. 5. 2018
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Angličtina
Známka
Velmi dobře
Klíčová slova (česky)
Virus hepatitidy B, kaspidový protein, ubikvitin proteazomový systémKlíčová slova (anglicky)
Hepatitis B virus, capsid protein, ubiquitin proteasome pathwayVírus hepatitídy B (HBV) patrí do rodiny Hepadnaviridae infikujúcej cicavce. Infekcia HBV môže viesť k akútnej alebo chronickej hepatitíde typu B. Chronická hepatitída B môže vyústiť do hepatocelulárneho karcinómu a cirhózy pečene, ktoré čato nesú fatálne následky. HBV je malý vírus o 42 nm, ktorého genóm má dĺžku 3.2 kb. Kóduje sedem proteínov. HBV Core proteín (HBc) je proteínom zodpovedným za tvorbu kapsidy vírusu. Taktiež, však u ňho bolo odhalených mnoho ďalších funkcií. Podarilo sa nám identifikovať dve ubikvitín ligázy, ktoré by mohli interagovať s HBc: FBXO3 (E3 ubikvitín ligáza) a UBE2O (E2/E3 ubikvitín ligáza). Využitím viacerých metód sa nám tieto interakcie podarilo potvrdiť. Ko-imunoprecipitáciou, a následnou analýzou pomocou western blot metódy, sme odkryli nové náhľady na možnú funkciu týchto dvoch proteínov, čo sa ubikvitinácie HBc týka: FBXO3 zvyšuje hladinu polyubikvitinácie u HBc, zatiaľ čo UBE2O podporuje jeho monoubikvitináciu. Taktiež sme sa zaoberali celkovým dopadom FBXO3 a UBE2O ligáz na životný cyklus a replikáciu vírusu. Potlačením expresie oboch ubikvitín ligáz v HBV transfekovyných bunkách sme prišli k záveru, že FBXO3 inhibuje replikáciu vírusu, kým UBE2O ju naopak podporuje. Je potrebná podrobnejšia analýza novozískaných výsledkov, avšak ich potenciál na lepšie...
Hepatitis B virus (HBV) is a Hepadnaviridae virus infecting mammals. Its infection can result in an acute or chronic infection. Chronic infection can result in hepatocellular carcinoma and liver cirrhosis, potentially leading to death of the patient. HBV is a small 42 nm virus with a genome length of 3.2 kb encoding seven viral proteins. HBV Core protein (HBc) is a capsid forming protein which is pleiotropic in function. We have identified two ubiquitin ligases which could interact with this protein: F-box only protein 3 (FBXO3; E3 ubiquitin ligase) and Ubiquitin conjugating enzyme E2 O (UBE2O; E2/E3 ubiquitin ligase). By employing multiple methods we have confirmed these interactions. Co- immunoprecipitation and further western blot analysis unveiled multiple new insights into the ligases′ impact on HBc: FBXO3-mediated HBc polyubiquitination stimulation and UBE2O-mediated HBc monoubiquitination promotion. FBXO3's and UBE2O's role in HBV life cycle was investigated as well. By silencing the expression of FBXO3 and UBE2O respectively, we have observed changes in HBV replication levels: FBXO3 serves as an inhibitor of HBV replication, while UBE2O stimulates the course of HBV life cycle. Further investigation of these newly-discovered understandings may lead to a whole new HBV - host interplay...