Systematika rodu Ramariopsis (Basidiomycota, Clavariaceae) ve střední Evropě
Systematics of the genus Ramariopsis (Basidiomycota, Clavariaceae) in central Europe
diploma thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/91286Identifiers
Study Information System: 159731
Collections
- Kvalifikační práce [19114]
Author
Advisor
Consultant
Koukol, Ondřej
Referee
Kučera, Viktor
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Botany
Department
Department of Botany
Date of defense
12. 9. 2017
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Very good
Keywords (Czech)
Ramariopsis, LSU, ITS, fylogeneze, morfologie, taxonomie, skrytá diverzitaKeywords (English)
Ramariopsis, LSU, ITS, fylogeny, morphology, taxonomy, cryptic diversityRod Ramariopsis (Clavariaceae, Agaricales) zahrnuje ve střední Evropě kolem 15 druhů s kuřátkovitými, vzácněji kyjankovitými plodnicemi. Jedná se pravděpodobně o saprotrofní druhy, které se vyskytují obvykle v lučních společenstvech nebo vzácněji na otevřených stanovištích v křovinách či listnatých lesích. V této práci bylo studováno 88 sběrů tohoto rodu především z České republiky a Slovenska, z nichž bylo získáno 57 sekvencí pro úsek LSU a 36 sekvencí pro úsek ITS. Na základě molekulárně-fylogenetických analýz metodami maximum likelihood a bayesovské analýzy byly vytvořeny fylogenetické stromy, které ukázaly 16 dobře podpořených kladů. Takto podrobná studie o fylogenezi a mezidruhových vztazích v rámci rodu Ramariopsis je představena vůbec poprvé, a to i v rámci světové literatury. Po následné morfologické analýze podpořené také SEM fotografiemi spor bylo zjištěno, že získané klady reprezentují devět druhů známých v taxonomické literatuře, tři zatím nepopsané druhy (označené provizorním jménem) a čtyři klady, jejichž interpretace je zatím nejistá. Sedm kladů tedy představuje odhalenou skrytou diverzitu, která byla v tomto rodě prokázána ve vysoké míře. Mezi další výsledky patří již publikovaný popis nového druhu Ramariopsis robusta Matouš et Holec a zjištění dvou nových taxonů pro území České...
The genus Ramariopsis (Clavariaceae, Agaricales) having ramarioid, rarely clavarioid basidiomata includes about 15 species in central Europe. They are probably saprotrophic species which usually occur in grasslands or rarely open places in shrubs or deciduous forests. In this work, 88 collections of this genus mainly from the Czech Republic and Slovakia were studied, of which 57 sequences from the LSU and 36 from the ITS regions of the nuclear ribosomal RNA gene complex were obtained. Based on molecular-phylogenetic analyses using the maximum likelihood and bayesian methods, phylogenetic trees were created showing 16 well-supported clades. So detailed study on the phylogeny and relationships among species of the genus Ramariopsis is presented for first time, even within the world literature. Subsequent morphological analysis supported by SEM study of basidiospores showed that obtained clades represent nine species known in taxonomic literature, three so far non-described species (that were labelled with provisional names) and four clades whose interpretation is uncertain at the moment. Thus, seven clades represent cryptic diversity, which is a rather high extent. A new species Ramariopsis robusta Matouš et Holec has already been published and Ramariopsis rufipes and Ramariopsis kunzei var. bispora...