Identification and functional characterization of C/EBPalpha targets in normal and malignant hematopoiesis
Identifikace a funkční charakterizace cílových genů C/EBPalpha v půběhu normální a maligní krvetvorby.
dissertation thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/86824Identifiers
Study Information System: 96342
Collections
- Kvalifikační práce [20052]
Author
Advisor
Referee
Stopka, Tomáš
Fuchs, Ota
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
-
Department
Department of Cell Biology
Date of defense
29. 6. 2017
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
English
Grade
Pass
Hematopoetickýsystémpředstavujevysoceorganizovanoustrukturu,kterákesvému správnémufungovánívyžadujepřesnouregulaci.Aberantnívývojkrevníchbuněkmůževést khematologickýmporuchám,jakojenapř.akutní myeloidníleukémie(AML).Správné fungování hematopoetickéhosystémuzávisízvelkéčásti natranskripčníchfaktorech. TranskripčnífaktorC/EBPjeznámjakojedenzhlavníchregulátorůkrvetvorbyajenezbytný profunkčnosthematopoetickýchkmenovýchbuněkavývojbuněkmyeloidnílinie.Významná jetakéskutečnost,žezměnyexpreseC/EBP bylydetekoványuvelkéčástipřípadůAML. C/EBPregulujekrvetvorbuzejménaprostřednictvímregulaceexpresesvýchcílovýchgenů. Byloprokázáno,žeřadatěchtogenůsenasystémukrvetvorbypodílíahrajerolipřileukemické transformaci.IdentifikacenovýchcílovýchgenůC/EBPajejichfunkčnícharakterizacesetak stávázajímavýmpředmětemvýzkumu.Vtétoprácijsmeidentifikovalisouborgenů,jejichž expresejenaaktivitěC/EBPzávislá,tzv."signaturu"C/EBP.Prokázalijsme,žeinhibitory histon-deacetyláz(HDAC)obnovujíexpresitěchtogenůvbuňkáchsnefunkčnímC/EBPa indukujímyeloidnídiferenciacivevzorcíchAMLsbialelickýmimutacemiCEBPA,kterése vyznačujísníženouexpresísignaturyC/EBP.Výzkumzaměřenýnajedenkonkrétnícílový gen C/EBP,EVI2B,dáleprokázal,žeproteinkódovanýtímtogenemjenezbytnýkesprávné...
Thehematopoieticsystemisahighlyorganizedstructure, whichhastobetightly regulatedinordertofunctionproperly.Abnormalitiesinhematopoieticdevelopmentmaylead tohematologicaldisorders,suchasacutemyeloidleukemia(AML).Thefunctionalityofthe hematopoieticsystemlargelyreliesontranscriptionfactors.C/EBPtranscriptionfactoris knownasoneofthe majorhematopoieticregulators,requiredforthefunctionalityof hematopoieticstemcellsaswellasformyeloidlineagedevelopment.Importantly,C/EBP expressionisalteredinalargeproportionofAMLcases.C/EBPregulateshematopoiesis mainlythroughorchestratingexpressionofitstargetgenes.ManyoftheC/EBPtargetshave previouslybeenshowntoplayaroleinthehematopoieticsystemandtobeinvolvedin leukemictransformation. That makesidentificationofnovel C/EBP targetsandtheir functionalcharacterizationanexcitingsubjectofresearch.Hereweidentifiedalistofgenes whoseexpressiondependsontheactivityofC/EBPthesocalledC/EBPsignature. We demonstratedthattreatment withhistonedeacetylase(HDAC)inhibitorsreactivatesthe expressionofthesegenesincellswithnon-functionalC/EBP.Inaddition,wedemonstrated thattreatmentwiththeHDACinhibitorspromotesmyeloiddifferentiationinAMLsamples carryingbi-allelicCEBPA mutationsandcharacterizedbythereducedexpressionofthe...