Epigenetický stav chromatinu proteinové jednotky telomerázy v modelové rostlině Nicotiana tabacum
Epigenetic nature of the telomerase protein subunit chromatin in Nicotiana tabacum model plant
rigorózní práce (UZNÁNO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/86316Identifikátory
SIS: 190985
Kolekce
- Kvalifikační práce [19109]
Autor
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Biochemie
Katedra / ústav / klinika
Katedra biochemie
Datum obhajoby
21. 6. 2017
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Čeština
Známka
Uznáno
Diplomová práce "Epigenetický stav chromatinu proteinové jednotky telomerázy v modelové rostlině Nicotiana tabacum" se věnuje regulaci této podjednotky na úrovni transkripce a roli epigenetických modifikací v tomto procesu u modelové rostliny Nicotiana tabacum (tabák viržinský). Tabák představuje z pohledu regulace telomerázy unikátní systém, v jeho genomu byly popsány tři sekvenční varianty genu kódujícího katalytickou podjednotku telomerázy - TERT. Teoretická část této práce se zabývá problematikou konců eukaryotických chromozomů - telomer, způsobu jejich udržování a prodlužování pomocí telomerázy, dále charakterizaci kovalentních modifikací DNA a histonů, které ovlivňují vlastnosti chromatinu v daném lokusu a tím i genovoutranskripci. V praktické části jsme se věnovali analýze transkripce variant genu TERT v pletivech N. tabacum a v rodičovské rostlině N. sylvestris a charakterizaci modifikací histonů v pletivech N. tabacum s aktivní a neaktivní telomerázou. Byl také studován vliv syntetických fytohormonů na transkripci variant NtTERT během klíčení semen N. tabacum. Transkripční profil variant NtTERT ukazuje, že pro aktivitu telomerázy je determinující varianta NtTERT-C/t a pseudogen NtTERT-D je pravděpodobně zapojen do negativní regulace aktivity telomerázy. Přítomnost syntetických auxinů během...
The diploma thesis "Epigenetic nature of the telomerase protein subunit chromatin in Nicotiana tabacum model plant" deals with the regulation of this subunit on the transcriptional level and the role of epigenetic modifications in this proces in the Nicotiana tabacum (tobacco) model plant. Tobacco represents unique system because in tobacco genome three sequence variants of the gene coding for telomerase catalytic subunit - TERT were identified. In the theoretical part of the thesis the ends of eukaryotic chromosomes - telomeres, their maintenance and elongation by telomerase are described, and characterization of epigenetic modifications of DNA and histones influencing properties of chromatin and gene transcription is presented. In the practical part of the diploma thesis, transcription of TERT gene variants in N. tabacum and N. sylvestris (donor of the mother genome part) tissues and modifications of histones in tissues with the positive and negative telomerase activity were analysed. Next, the influence of synthetic phytohormones on the NtTERT transcription during N. tabacum seeds germination was investigated. The transcription profile of NtTERT gene variants indicated that the NtTERT-C/t variant is relevant for telomerase activity and the pseudogene NtTERT-D is probably involved in negative...