Molekulární charakterizace rezistence k MLSb antibiotikům u kmenů Staphylococcus aureus a SCV Staphylococcus aureus od pacientů s cystickou fibrózou

Abstract

Cystická fibróza (CF) je nejčastější autozomálně recesivní onemocnění v kavkazské populaci. Kolonizace dolních cest dýchacích (DCD) bakteriemi vede u pacientů s CF z důvodu narušených procesů přirozené slizniční imunity k chronické infekci a nevratnému poškození plic. V této práci bylo charakterizováno 338 kmenů S. aureus izolovaných v letech 2011-2013 z DCD 92 českých pacientů s CF. Metodou spa typizace a makrorestrikční analýzou pomocí PFGE byla zjištěna vysoká klonální heterogenita souboru. Výjimku tvořily klonálně téměř totožné kmeny MRSA (rezistentní k oxacilinu; 5% prevalence). Prevalence rezistence kmenů S. aureus k MLSB antibiotikům dosáhla v našem souboru 69 % a představuje závažný problém vzhledem ke klinickému použití této skupiny léčiv. U poloviny MLSB rezistentních kmenů nebyla detekována žádná determinanta rezistence (ermA, ermC, ermT, msrA). Sekvenováním ribozomálních genů byl v našem souboru prokázán neobvykle vysoký podíl kmenů s mutacemi v zásahových místech MLSB antibiotik (u 37 % pacientů), což je nová zásadní informace z analýzy kmenů od pacientů s chronickou stafylokokovou infekcí v ČR. Proto byla ověřena mutabilita těchto kmenů. Prozatím se podařilo detekovat u několika kmenů bodové mutace i delece v mutátorových genech mutS a mutL. Hypermutabilita by mohla vysvětlovat vysoký podíl...

Cystic fibrosis (CF) is the most common autosomal recessive genetic disorder in Caucasians. Lower respiratory tract of CF patients is colonized by specific bacteria, often leading to chronic infection and lung tissue damage. In this thesis we characterized 338 isolates of S. aureus from 92 Czech CF patients isolated in 2011-2013. Using spa typing and PFGE we detected high clonal heterogenity of this collection with the exception of MRSA strains (resistant to oxacillin; 5% prevalence) which were clonally related. The prevalence of S. aureus MLSB resistance in our collection was high (69 %), which is a serious problem due to common usage of these antimicrobials in clinical practice. A half of the MLSB resistant strains lacked any known determinant of this resistance (ermA, ermC, ermT, msrA). Sequencing of the ribosomal genes revealed a high number of S. aureus strains carrying target site mutations resulting in MLSB resistance (37 %). This is new important information about the staphylococcal strains associated with chronic infections in Czech Republic. Focusing on mutability of analysed strains, we also detected several strains with point mutations or deletions in their mutator genes mutS a mutL. Hypermutability could be responsible for the high rate of ribosomal mutations and for the presence of...