The plasticity of melanoma cell invasiveness
The plasticity of melanoma cell invasiveness
diploma thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/75635Identifiers
Study Information System: 156730
Collections
- Kvalifikační práce [20073]
Author
Advisor
Referee
Truksa, Jaroslav
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Cellular and Developmental Biology
Department
Department of Cell Biology
Date of defense
7. 6. 2016
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
English
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
invazivita, améboidní, Rho GTPázy, Jak, Stat, NFĸB, MAT, AMTKeywords (English)
invasiveness, amoeboid, Rho GTPases, Jak, Stat, NFĸB, MAT, AMTa klíčová slova: Během metastazování mohou rakovinové buňky využívat různé strategie pro invazi skrz extracelulární matrix. Při individuální invazi využívají buď améboidní migrační mód, během kterého buňka dynamicky mění tvar díky zvýšené kontraktilitě tak, aby mohla prolézat póry v extracelulárním prostředí, nebo mesenchymální migraci, která je závislá na proteolytickém štěpení a využívá možnosti degradace okolní tkáně. Buňky migrující v daném módu mohou aktivně přecházet do druhého módu v procesu mesenchymálně-améboidního přechodu (MAT) nebo améboidně-mesenchymálního přechodu (AMT). To jim nabízí únikové cesty, což značně komplikuje léčbu metastatické rakoviny. Je známo, že Rho GTPázy jsou hlavními regulátory přestavby cytoskeletu a není tedy překvapením, že hrají důležitou roli v obou migračních modech a mohou přímo řídit přechody mezi nimi. Nicméně, aktivace těchto drah je stále poměrně nejasná. Tato práce si kladla za cíl optimalizovat 3D podmínky vhodné pro studium plasticity invazivních módů in vitro, poté na bázi manipulace s Rho GTPázami ustanovit modely pro studium AMT a MAT v melanomových buňkách a ověřit nové kandidáty regulující plasticitu buněčné invazivity dle předchozích dat získaných sekvenováním RNA z buněk před a po MAT. Nakonec, pomocí syntézy publikovaných dat, výsledků ze...
and keywords: During metastasis, cancer cells can invade the extracellular matrix using various strategies. When invading individually, they employ either the amoeboid invasion mode, during which the cell body dynamically deforms by enhanced contractility to squeeze through pores within the matrix, or protease dependent mesenchymal migration that takes advantage of the possibility to digest the surrounding matrix. Cells migrating in one mode can actively switch to the other by mesenchymal-amoeboid (MAT) or amoeboid-mesenchymal transitions (AMT). This enables escape mechanisms and considerably complicates anti-metastatic treatment. It is well known that Rho GTPases are master regulators of cytoskeleton re-arrangements and thus, unsurprisingly, play a major role in both invasion modes and can directly drive the transitions. However, upstream activation of these pathways is still largely unclear. This thesis aimed to optimize 3D conditions suitable for studying plasticity of cell invasion in vitro, establish AMT and MAT in melanoma cells based on manipulation of Rho GTPases and verify novel candidates regulating cell invasion plasticity based on previous RNA sequencing of cells before and after MAT. Last, by synthesis of published data, results from sequencing and new findings presented in this...