Study of NKp30 oligomerization and its interaction with B7-H6
Studium oligomerizace proteinu NKp30 a jeho interakce s B7-H6
diplomová práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/73770Identifikátory
SIS: 158453
Kolekce
- Kvalifikační práce [19114]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Man, Petr
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Biochemie
Katedra / ústav / klinika
Katedra biochemie
Datum obhajoby
5. 9. 2016
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Angličtina
Známka
Velmi dobře
Klíčová slova (česky)
NK buňka, glykosylace, oligomerizace, NKp30, B7-H6Klíčová slova (anglicky)
NK cell, glycosylation, oligomerization, NKp30, B7-H6NK buňky jsou důležitou součástí imunitního systému. Jsou schopné rozeznat a zničit nádorové buňky a buňky infikované virem. Pro rozpoznání jejich cílových buněk hrají důležitou roli jejich aktivační receptory. Aktivační receptor NKp30, protein z rodiny přirozeně cytotoxických receptorů, váže několik ligandů přítomných na povrchu nádorových buněk anebo tvořících části některých virů. B7-H6 je jedním z ligandů NKp30 a díky jeho specifické konstitutivní expresi na povrchu některých nádorů a nádorových buněk je zajímavým biologickým cílem. Ačkoli již byla struktura komplexu NKp30/B7-H6 vyřešena, strukturní podstata některých důležitých vlastností vazby komplexu zatím nebyla vysvětlena. NKp30 tvoří oligomery, jejichž přítomnost je ovlivněna délkou C-konce NKp30 a jeho N-glykosylací, avšak strukturní podstata a ani význam těchto oligomerů nejsou známy. Navíc je vazebná afinita NKp30 k jeho ligandům ovlivněna přítomností jeho glykosylace a také jejím typem. V naší laboratoři jsme již dříve zjistili, že oligomerizace NKp30 je závislá na jeho glykosylaci. V mé práci jsem se pokusil získat detailnější funkční a strukturní informace o oligomerizaci NKp30 a vazbě B7-H6 multimetodickým přístupem včetně rentgenové krystalografie. Zodpovězení vznesených otázek by nejen přispělo k základnímu výzkumu aktivačních...
NK cells are important part of immune system, recognizing and eliminating tumor cells and cells infected by viruses. For the target cell recognition, binding of ligands by activating receptors plays a crucial role. Activating receptor NKp30, protein of family of natural cytotoxicity receptors, is able to bind multiple ligands either present on tumor cell surface or being part of some viruses. B7-H6 is one of the ligands of NKp30 and its specific constitutive expression on some tumor cells and cell lines makes it an interesting biological target. Although the NKp30/B7-H6 complex structure has been solved, structural basis of some important features of their binding is not explained yet. Soluble form of NKp30 receptor binding domain creates oligomers, presence of which is dependent on C-terminus length of its domain and its N-glycosylation; however, structural insight into formation of the oligomers and their significance is not known. Furthermore, binding affinity of NKp30 to its ligands is dependent on presence of its glycosylation and glycosylation type. We have already found out that NKp30 oligomerization is dependent on its glycosylation. In my work, I attempted to gain detailed functional and structural information about oligomerization of NKp30 and its binding to B7-H6 by multimethodical...