Rodina proteinů obsahujících sterol-sensing doménu
Rodina proteinů obsahujících sterol-sensing doménu
bachelor thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/68766Identifiers
Study Information System: 143405
Collections
- Kvalifikační práce [19113]
Author
Advisor
Referee
Fafílek, Bohumil
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Molecular Biology and Biochemistry of Organisms
Department
Department of Cell Biology
Date of defense
13. 6. 2014
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
English
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
sterol sensing doména, signální dráha Hedgehog, proteiny vázající sterol, syntéza cholesterolu, transport cholesteroluKeywords (English)
sterol sensing domain, Hedgehog signalling pathway, sterol binding protein, cholesterol synthesis, cholesterol traffickingSterol sensing doména (SSD) je transmembránový úsek proteinu skládající se z 5 helixů. Proteiny, které tuto doménu obsahují, jsou součástí mnoha buněčných drah souvisejících s metabolismem cholesterolu. V některých případech bylo ukázáno, že SSD interaguje s molekulou cholesterolu. Poprvé byla popsána během studia 3-hydroxy-3-metylglutaryl-CoA reduktázy (HMG-CoA reduktáza), enzymu účastnícího se biosyntézy cholesterolu. Jeho transkripce je regulována proteinem Sterol regulatory element binding protein Cleavage Activating Protein (SCAP). 3HMG-CoA reduktáza a SCAP byly prvními proteiny, v jejichž struktuře byla SSD rozeznána. Později byl popsán jiný protein s touto doménou, který je také součástí biosyntézy cholesterolu - 7-dehydrocholesterol reduktáza. Další proteiny s identifikovanou SSD, hrají roli v endocytóze cholesterolu a jeho transportu z lysozomů - Niemann-Pick typ C 1 liked 1 a Niemann-Pick typ C 1. Mimoto, jako struktury obsahující SSD byly také popsány proteiny působící v Hedgehogové signalizaci - Patched, Patched-related a Dispatched. Konečně, protein působící jako tumor-supresor TRC8 byl do této rodiny proteinů zařazen také. V této práci je popsána struktura a funkce jednotlivých členů proteinové rodiny obsahující sterol sensing doménu. Klíčová slova: sterol sensing doména, signální...
1. Abstract Sterol sensing domain (SSD) is a putative transmembrane region consisting of 5 helices and in few cases it was shown that it interacts with cholesterol. Proteins containing this domain play a role in many cellular pathways connected to cholesterol. It was first described in a study of 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase (HMG-CoA reductase). It is an enzyme playing role in cholesterol biosynthesis and its transcription is regulated by sterol regulatory element binding protein cleavage activating protein (SCAP). HMG-CoA reductase and SCAP were the first proteins where SSD was recognized. After that, other proteins were described; one more protein functioning in cholesterol biosynthesis was described as containing SSD - 7-dehydrocholesterol reductase. Also two proteins playing role in cholesterol endocytosis - Niemann-Pick type C 1 liked 1 - and in its efflux from lysosomes - Niemann-Pick type C 1 - were recognized. Furthermore, proteins playing role in Hedgehog signalling Patched, Patched-related and Dispatched were found as SSD containing structures. In the end, tumour-suppressor gene TRC8 was also recognized as member of SSD family. In this text, structure and function of these proteins is summarized. Key words: sterol sensing domain, Hedgehog signalling pathway, sterol binding protein,...