Candida parapsilosis secreted aspartic proteinases: processing and secretion
Sekretované aspartátové proteasy kvasinky Candida parapsilosis: štěpení prekursoru a sekrece
dissertation thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/64631Identifiers
Study Information System: 89789
Collections
- Kvalifikační práce [19113]
Author
Advisor
Referee
Hodek, Petr
Szotáková, Barbora
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
-
Department
Department of Biochemistry
Date of defense
4. 6. 2015
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
English
Grade
Pass
Keywords (Czech)
Candida parapsilosis, Saccharomyces cerevisiae, sekretované aspartátové protasy, Sapp1p, SAPP1, Sapp2p, SAPP2, buněčná stěna, biotinylace, štěpení prekursoru, metabolismus dusíku, sekreceKeywords (English)
Candida parapsilosis, Saccharomyces cerevisiae, secreted aspartic proteinases, Sapp1p, SAPP1, Sapp2p, SAPP2, cell wall, biotinylation, proteolytic activation, nitrogen metabolism, secretionCandida parapsilosis je lidský oportunní patogen, jehož klinický význam vzrůstá, a který způsobuje širokou škálu potencionálně život ohrožujících infekcí u jedinců s oslabeným imunitním systémem. Jedním z nejvýznamějších virulenčních faktorů kvasinek Candida je produkce sekretovaných aspartátových proteas (Saps). Předkládaná disertační práce se zabývá převážně studiem sekretované aspartátové proteasy 1 (Sapp1p) kvasinky C. parapsilosis, jejím procesem aktivace a sekrece za různých podmínek a s využitím různých experiemntálních modelů. Sapp1p je sekretovaná buňkami C. parapsilosis do mimobuněčného prostoru se zcela odštěpeným pre-pro-peptidem a plně proteolyticky aktivní. Pokusy studující buněčnou stěnu C. parapsilosis prokázaly prodlouženou přítomnost zcela aktivované proteasy na buněčném povrchu (CW-Sapp1p). Metoda pro měření enzymové aktivity Sapp1p provedená na neporušených buňkách ukázala, že CW-Sapp1p je proteolyticky aktivní ještě před svým uvolněním do mimobuněčného prostoru a je schopná štěpit substrát. Pokusy s biotinylací a následnou analýzou pomocí hmotnostní spektrometrie ukázaly, že biotinylace CW-Sapp1p je proces saturovatelný, jehož výsledkem ale nejsou plně naznačené molekuly. Přístupnost jednotlivých lysinových zbytků byla v molekule Sapp1p proměnlivá s výjimkou čtyř zbytků, které...
Candida parapsilosis is an emerging human opportunistic pathogen causing a wide spectrum of potentially life-threatening infections in immunocompromised hosts. One of the most important virulence factors of Candida spp. is a production of secreted aspartic proteinases (Saps). Presented thesis is mainly focused on the study of secreted aspartic proteinase 1 (Sapp1p) of C. parapsilosis, its processing and secretion under variable conditions and by use of various experimental models. Sapp1p is secreted by C. parapsilosis cells into the extracellular space as a completely processed and fully active enzyme. Experiments studying the C. parapsilosis cell wall (CW) confirmed the prolonged presence of completely processed Sapp1p on the cell surface (CW- Sapp1p). Proteolytic activity assay performed with the intact cells showed that CW-Sapp1p is proteolytically active prior to its release into the extracellular space and is capable of substrate cleavage. Biotinylation experiments with consecutive MS analysis revealed that CW-Sapp1p biotinylation is incomplete but saturable process, leaving partially unlabelled molecules. The accessibility of individual lysine residues in the Sapp1p molecule varied, with exception of four residues that were labelled in all of our experiments performed. The final step of...