Transport U2 snRNA do Cajalových tělísek
U2 snRNA targeting to Cajal bodies
diplomová práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/62967Identifikátory
SIS: 128802
Kolekce
- Kvalifikační práce [19109]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Mašek, Tomáš
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Genetika, molekulární biologie a virologie
Katedra / ústav / klinika
Katedra genetiky a mikrobiologie
Datum obhajoby
15. 9. 2014
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Čeština
Známka
Velmi dobře
Klíčová slova (česky)
snRNP, Cajalova tělíska, snRNA, buněčné jádroKlíčová slova (anglicky)
snRNP, Cajal bodies, snRNA, cell nucleusV jádře buňky můžeme nalézt velké množství malých nekódujících RNA, které zastávají nejrůznější důležité funkce. Mezi ně řadíme i malé jaderné RNA bohaté na uridin zvané U snRNA, které společně s proteiny tvoří U snRNP. Tyto částice hrají velmi důležitou roli v sestřihu pre-mRNA. Při tomto procesu jsou odstraňovány nekódující sekvence zvané introny a spojovány kódující sekvence zvané exony. Vše je katalyzováno sestřihovým komplexem, jehož jádro je tvořeno U1, U2, U4, U5 a U6 snRNP. Tyto částice jsou pro tuto posttrasnkripční úpravu zcela nepostradatelné. Některé kroky formování těchto U snRNP probíhají v jaderných strukturách zvaných Cajalovo tělísko (CB). V mé práci jsem se zaměřila na faktory, které jsou důležité pro cílení snRNA do Cajalových tělísek. Jako modelovou snRNA jsem použila U2 snRNA. Pomocí mikroinjekce fluorescenčně značených zkrácených U2 snRNA jsem zjistila, že pro cílení do CB je nezbytná sekvence, na kterou se váží Sm proteiny. Deplece Sm proteinu SmB/B'nám ukázala, že Sm proteiny jsou pro lokalizaci U2 snRNA do CB esenciální. Sm proteiny jsou formovány na U2 snRNA pomocí SMN komplexu. Odstranění sekvence v U2 snRNA, na kterou se SMN komplex váže, mělo stejný inhibiční efekt na cílení do CB jako deplece Sm proteinu. Z čehož vyplývá, že Sm proteiny a SMN komplex jsou nezbytné pro...
In the cell we can find a lot of small noncoding RNAs, which are important for many processes. Among those RNAs are small nuclear RNA uridin rich, which with proteins create U snRNP.These particles play important role in pre-mRNA splicing. In this process are noncoding sequences (introns) removed and coding sequences (exons) are joined. It is catalyzed by spliceosome. The core of this spliceosome is created by U1, U2, U4, U5 and U6 snRNP. They are essential for this process. Some steps of U snRNP biogenesis proceed in nuclear structures called Cajal bodies (CB). In my thesis I focused on factors, which are important for targeting U snRNA into CB. I used U2 snRNA like a model. With the aid of microinjection of fluorescently labeled U2 snRNA mutants I found, that the Sm binding site on U2 snRNA is essential for targeting to CB. Knock down of Sm B/B'showed us, that Sm proteins are necessary for transport U2 snRNA to CB. Sm proteins are formed on U2 snRNA by SMN complex. Deletion of SMN binding site on U2 snRNA had the same inhibition effect. From these results we can see, that Sm proteins and SMN complex are important for U2 snRNA biogenesis espacially for targeting into CB. Key words: U snRNP, Cajal body, U snRNA, cell nucleus