Genetická diverzita raka kamenáče v okrajových částech areálu
Genetic diversity of stone crayfish Austropotamobius torrentium in marginal areas of its distribution
diploma thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/54290Identifiers
Study Information System: 117606
Collections
- Kvalifikační práce [20084]
Author
Advisor
Referee
Kouba, Antonín
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Ecology
Department
Department of Ecology
Date of defense
17. 9. 2013
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Excellent
Střední Evropa na sever od Alp byla kolonizována jednou z balkánských haplotypových linií raka kamenáče Austropotamobius torrentium po konci poslední doby ledové. V povodí Dunaje a Rýna je rak kamenáč považován za původní druh. Původ populací v povodí Labe je stále diskutován, řada recentních evropských prací zabývajících se rozšířením raků udává raka kamenáče v povodí Labe jako nepůvodní druh. Hlavním cílem mé práce bylo zhodnotit otázku původu raka kamenáče v povodí Labe pomocí popisu rozložení genetické variability, která dosud nebyla v povodí Labe u raka kamenáče studována. K tomuto účelu byl použit 617 párů bází dlouhý úsek mitochondriálního genu malé podjednotky I cytochrom c oxidázy. Variabilita tohoto markeru je u populací na sever od Alp snížená, což souhlasí s předpokladem rychlé kolonizace po skončení poslední doby ledové. Nalezená haplotypová diverzita je nicméně dostatečná pro zodpovězení dané otázky. Mezi 22 populacemi z povodí Labe byl nalezen jeden dominantní a tři vzácné haplotypy. Jedinci z izolovaného Lučního potoka v Podkrkonoší mají haplotyp, který byl dosud nalezen jen ve středním Slovinsku, a tato populace je pravděpodobně introdukovaná. Krom toho byly nalezeny dva vzácné haplotypy z nichž jeden se vyskytuje kromě povodí Labe také v jižním Německu a druhý je pro povodí Labe unikátní....
Central Europe north of the Alps was colonized by one of the Balkan haplotype lineage of stone crayfish Austropotamobius torrentium after the end of the last ice age. Stone crayfish is considered a native species in the basins of the Danube and the Rhine. The origin of populations from the Elbe basin is still debated. Most of recent European studies dealing with the crayfish distribution indicate the stone crayfish in Elbe basin as non-indigenous species. The main aim of my work was to evaluate the question of the origin of stone crayfish in the Elbe catchment by describing the distribution of genetic variability, which has not been yet studied in the Elbe river basin for this species. I have used 617 base pairs long section of mitochondrial gene for small subunit I of cytochrome c oxidase (COI). The variability of this marker is reduced in area on the north of Alps, which agrees with assumption of rapid colonization after the end of last ice age. Observed haplotype diversity is nevertheless sufficient to suggest the most likely scenario. Among 22 populations from Elbe basin, one dominant and three rare haplotypes were found. Individuals from the isolated Luční creek close to the Krkonoše (Giant Mountains) region have a haplotype that has so far been found only in central Slovenia, and this population has...