Populační výskyt polymorfismu genu pro serotoninový transportér.
The serotonin transporter gene - polymorphism incidence study.
diploma thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/48458Identifiers
Study Information System: 79125
Collections
- Kvalifikační práce [20115]
Author
Advisor
Referee
Goetz, Petr
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Genetics, Molecular Biology and Virology
Department
Department of Genetics and Microbiology
Date of defense
19. 9. 2011
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Good
Serotonin (5-hydroxytryptamin; 5-HT) je neurotransmiter centrálního a periferního nervového systému. Serotoninový transportér 5-HTT hraje důležitou roli v serotonergní transmisi a gen pro tento protein je studován ve spojení s mnoha psychiatrickými onemocněními. Polymorfizmy typu inzerce/ delece a SNP v promotorové oblasti genu a variantní počet tandemových repetic (VNTR) v oblasti intronu 2 řídí expresi 5-HTT genu. Testovali jsme tyto tři polymorfizmy transportního proteinu (SLC6A4) ve vzorku tří skupin z české populace. Jednotlivé skupiny byly vytvořeny na základě věkového rozdílu. První skupina- náhodně vybraní staří lidé ve věku nad 75 let v rovnoměrném zastoupení obou pohlaví. Druhá skupina- lidé středního věku s rovnoměrným zastoupením obou pohlaví. A třetí skupina tvořená novorozenci. Studované oblasti byly naamplifikovány pomocí PCR a délkově rozlišeny pomocí 2% agarózového gelu nebo pomocí kapilární elektroforézy. SNP v intronu 2 byl detekován pomocí RFLP metody použitím restrikčního enzymu MspI. Tato analýza prokázala vyšší přítomnost L alely délkového polymorfizmu u starých lidí v porovnání s kontrolami. To můžeme považovat za důsledek protektivního charakteru L alely, která je spojována s nižší náchylností k bipolární afektivní poruše, depresím, závislosti na alkoholu či neuroticismu.
Serotonin (5-hydroxytryptamine; 5-HT) is a neurotransmitter in the central and peripheral nervous systems. Serotonin transporter 5-HTT plays an important role in serotogenic transmisssion and the serotonin transporter gene is under investigation in connection with multiple psychiatric disorders. Three polymorphisms, an insertion/deletion and SNP in the promoter region and a variable nucleotide tandem repeat (VNTR) in intron 2, influence expression of the 5-HTT gene. We examined these polymorphisms at the serotonin transporter protein locus (SLC6A4) in three specific and representative cohorts drawn from the Czech population. These cohorts were stratified according to their age: a) randomly selected elderly individuals (over 75 years of age), b) young adults (age ranging between 19- 45 years) and c) newborns, all with balanced gender representation. The two regions were amplified and resolved on a 2% agarose gel and/or analyzed using the capillary electrophoresis in order to discriminate lenght polymorphisms. SNP in intron 2 was examined by RFLP after using MspI restriction. This analysis revealed that elderly individuals were statistically more likely than controls to carry two copies of the L allele of the lenth polymorphism. This may be due to the protective character of L allele, which is associated with...