Molecular phylogeny and evolutionary trends in Hieracium (Asteraceae, Lactuceae)
Molekulární fylogeneze a evoluční trendy v rodě Hieracium (Asteraceae, Lactuceae)
dizertační práce (OBHÁJENO)
Důvod omezené dostupnosti:
Přílohy práce nebo její části jsou nepřístupné v souladu s čl. 18a odst. 7 Studijního a zkušebního řádu Univerzity Karlovy v Praze ve spojení s čl. 9 opatření rektora č. 6/2010.
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/45161Identifikátory
SIS: 84716
Kolekce
- Kvalifikační práce [19614]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Zozomová, Judita
Nieto Feliner, Gonzalo
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Botanika
Katedra / ústav / klinika
Katedra botaniky
Datum obhajoby
20. 8. 2012
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Angličtina
Známka
Prospěl/a
Klíčová slova (česky)
Hieracium, molekulární fylogeneze, hybridizace, evoluceKlíčová slova (anglicky)
Hieracium, molecular phylogenetics, hybridization, evolutionPravé jestřábníky (Hieracium podrod Hieracium s. str.) se vyznačuje extrémní morfologickou variabilitou a různorodostí ploidních úrovní, která je spojená s různýma způsoby reprodukce. Předpokládá se, že v minulosti probíhala v rámci podrodu rozsáhlá hybridizace. V současné době je však hybridizace velice vzácná. Taxonomie podrodu je dost dobře propracována a diverzita na úrovni druhů je podrobně popsaná. Na druhé straně evoluční vztahy mezi jednotlivými druhy zatím nebyli studovány. Tato studie představuje první a zatím jedinou práci zaměřenou na objasnění těchto vztahů pomocí molekulárně biologických metod. Do analýz byly zahrnuty výlučně základní druhy (diploidní i polyploidní), které jsou morfologicky dobře odlišitelné a jsou chápány jako základní evoluční linie v rámci podrodu. Byli analyzovány sekvence dvou úseků chloroplastové DNA (trnT-trnL and trnV-ndhC) a mezerníkového úseku ETS, jádrové ribosomální DNA (nrDNA). V rámci studie byli vyvinuty tři nové low-copy jaderné markery, vhodné pro fylogenetické analýzy u Hieracium s. str., a každý z nich vykazoval vyšší variabilitu než nrDNA ETS. Jeden z nich, konkrétně část genu kódujícího enzym Squalen syntetázu (sqs), byl využit v rámci studie jako další jaderný úsek. Na základě analýzy sekvencí nrDNA ETS byly v podrodu Hieracium s. str....
The hawkweed subgenus Hieracium s. str. is notoriously known for its extreme morphological variability and variation in ploidy levels that is associated with differences in modes of reproduction. Extensive past hybridization is supposed for the subgenus, but recent hybridization was evidenced only in few cases. The subgenus attracts the attention of botanists already for more than a century. Therefore the species diversity is largely examined and the taxonomy of the subgenus is well elaborated, although several contradictory taxonomic concepts exist. However the relationships among the species are unknown and haven't been studied yet. The investigation of these relationships from a phylogenetic perspective using molecular approaches was the main aim of the presented thesis. Basic species (both diploid and polyploid), representing morphologically unique taxa, that are supposed to be the basic evolutionary units of the subgenus were studied. The sequences of two intergenic spacers of the cpDNA (trnT-trnL and trnV-ndhC) and the external transcribed spacer of the nuclear ribosomal DNA (nrDNA ETS) were analyzed. Moreover, three new low-copy nuclear markers with higher variability than nrDNA and cpDNA markers were developed and their suitability for phylogenetic studies in Hieracium s. str. was...