Signální transdukce v čichových senzorických neuronech obratlovců a nástroje pro její počítačovou simulaci
Signal transduction in olfactory sensory neurons of vertebrates and tools for the computer simulation
bachelor thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/44837Identifiers
Study Information System: 117727
Collections
- Kvalifikační práce [19113]
Author
Advisor
Consultant
Novotný, Jiří
Referee
Hejnová, Lucie
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Molecular Biology and Biochemistry of Organisms
Department
Department of Physiology
Date of defense
13. 9. 2012
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Good
Keywords (Czech)
čichová transdukce, čichový senzorický neuron, modelování, simulační prostředí, biofyzikální modelyKeywords (English)
olfactory transduction, olfactory sensory neuron, simulation, simulative environment, biophysical modelsCílem této práce je shrnout poznatky o čichové transdukci obratlovců. Tato rešerše je rozdělena do čtyř částí, přičemž každá část je zaměřena na jiný aspekt čichové transdukce. Nejprve je proveden přehled základních elektrofyziologických metod používaných pro výzkum transdukce. Následuje podrobný popis celé transdukce na molekulární úrovni. Další část práce shrnuje, jaké jsou typy modelů a jak se dají využít při modelování čichové transdukce. V závěru této části je proveden podrobný popis dvou modelů. Jeden z nich popisuje počátek čichové transdukce od vazby odorantu na receptor po produkci cAMP a druhý se zabývá zpětnou negativní vazbou Ca2+. Rešerše je zakončena přehledem softwarových nástrojů pro vytváření a analýzy modelů z předešlé části.
The purpose of this thesis is summing up the information about olfactory transduction of vertebrates. This review is divided into four parts, each part focuses on a different aspect of olfactory transduction. First there is an overview of basic electrophysiological methods used for transduction research, followed by a description of a complete transduction on a molecular level. Next is a summary of model types and their use in olfactory transduction simulation, including a detailed description of two models: One of them describes the beginning of olfactory transduction, from the odorant binding on the receptor to the cAMP production, the other deals with the negative feedback of Ca2+. Finally there is an overview of software products designed to create and analyze the models from the preceding section.