Peptidasy rodiny M16B a evoluční souvislosti mezi nimi
Processing peptidases of M16B family and their evolutionary relationships
bachelor thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/44808Identifiers
Study Information System: 116206
Collections
- Kvalifikační práce [19109]
Author
Advisor
Consultant
Janata, Jiří
Referee
Šulc, Miroslav
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Biochemistry
Department
Department of Biochemistry
Date of defense
11. 9. 2012
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
mitochondrie, hydrogenosom, mitochondriální "processingˮ peptidasa, hydrogenosomální "processingˮ peptidasa, rodina M16B, smyčka bohatá na glycin, cílená mutagenezeKeywords (English)
mitochondria, hydrogenosome, mitochondrial processing peptidase, hydrogenosomal processing peptidase, M16B family, glycine-rich loop, site-directed mutagenesisSouhrn V teoretické části tato bakalářská práce pojednává o skupině peptidas rodiny M16B. Detailněji se zabývá strukturou a evolucí mitochondriální a hydrogenosomální ,,processingˮ peptidasy a také hypotetickou proteasou z bakterie Rickettsia prowazekii. V praktické části této práce byly prostřednictvím metody cílené mutageneze připraveny konstrukty kódující α-podjednotku hydrogenosomální ,,processingˮ peptidasy (α- HPP) se zaměněným zbytkem tryptofanu v pozici 236 za fenylalanin a tyrosin. Následně byl do konstruktu α-HPP zaveden nový reportérový zbytek tryptofanu do pozice 256, 260, 267 nebo 271 v oblasti tzv. smyčky bohaté na glycin.
The theoretical part of this bachelor thesis deals with the group of processing peptidase of the M16B family. The main focus is on the structure and the evolution of mitochondrial and hydrogenosomal processing peptidase and also the hypothetical peptidase from the bacterium Rickettsia prowazekii. In the practical part of this work, the constructs coding the α-subunit of hydrogenosomal processing peptidase (α-HPP) with the substituted tryptophan residue in the position 236 for phenylalanine and tyrosine were prepared using the site-directed mutagenesis. Subsequently, the new reporter tryptophan residue was introduced in α-HPP in positions 256, 260, 267 or 271 in the so-called glycine-rich loop.