Isotypové složení aktinu v rostlinné buňce
Actin isoforms in the plant cell
bachelor thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/36627Identifiers
Study Information System: 66526
Collections
- Kvalifikační práce [19613]
Author
Advisor
Consultant
Fischer, Lukáš
Referee
Fišerová, Jindřiška
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Molecular Biology and Biochemistry of Organisms
Department
Department of Experimental Plant Biology
Date of defense
9. 6. 2011
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
rostlinný aktin, isotyp aktinu, protein vázající aktin, redundance isotypůKeywords (English)
plant actin, actin isotype, actin-binding protein, isotype redundancyPráce se zabývá otázkou redundance aktinových isotypů v rostlinných buňkách, zejména v Arabidopsis thaliana; předkládány jsou důkazy svědčící pro redundanci i proti ní. Zaměřuje se na podobnosti a odlišnosti na úrovni struktury genů, sekvencí genů i proteinů, exprese, regulace exprese, funkce. Přes některé konzervované vlastnosti (struktura aktinového genu, proteinová sekvence, ortology jsou si podobnější než paralogy) existují mezi isotypy odlišnosti (regulační a nekódující sekvence, expresní profily), doby divergencí jednotlivých isotypů navíc korelují s významnými událostmi v evoluci rostlin. Dále se práce zaměřuje na funkce aktinových isotypů v rostlinách. Práce zároveň vytyčuje vhodné směry budoucího výzkumu.
The thesis deals with a question of redundancy in plant actin isotypes, especially in a case of Arabidopsis thaliana. Available proofs both confirm and disprove the redundancy of actin isotypes. Similarities and differences in gene structure are considered, as well as gene and protein sequence, expression, expression regulation and function. Despite conserved features as the gene structure, protein sequence, or higher similarity among ortologues than paralogues, there are differences in actin gene families such as the regulation of genes expression, the structure and function of non-coding sequences, or expression patterns. Moreover, actin isotypes divergetion times correlate with important events in plant evolution history. The thesis also deals with diverse functions of actin isotypes in plants. In addition, directions for future research are provided as well.