Isotypové složení aktinu v rostlinné buňce
Actin isoforms in the plant cell
bakalářská práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/36627Identifikátory
SIS: 66526
Kolekce
- Kvalifikační práce [19109]
Autor
Vedoucí práce
Konzultant práce
Fischer, Lukáš
Oponent práce
Fišerová, Jindřiška
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Molekulární biologie a biochemie organismů
Katedra / ústav / klinika
Katedra experimentální biologie rostlin
Datum obhajoby
9. 6. 2011
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Čeština
Známka
Výborně
Klíčová slova (česky)
rostlinný aktin, isotyp aktinu, protein vázající aktin, redundance isotypůKlíčová slova (anglicky)
plant actin, actin isotype, actin-binding protein, isotype redundancyPráce se zabývá otázkou redundance aktinových isotypů v rostlinných buňkách, zejména v Arabidopsis thaliana; předkládány jsou důkazy svědčící pro redundanci i proti ní. Zaměřuje se na podobnosti a odlišnosti na úrovni struktury genů, sekvencí genů i proteinů, exprese, regulace exprese, funkce. Přes některé konzervované vlastnosti (struktura aktinového genu, proteinová sekvence, ortology jsou si podobnější než paralogy) existují mezi isotypy odlišnosti (regulační a nekódující sekvence, expresní profily), doby divergencí jednotlivých isotypů navíc korelují s významnými událostmi v evoluci rostlin. Dále se práce zaměřuje na funkce aktinových isotypů v rostlinách. Práce zároveň vytyčuje vhodné směry budoucího výzkumu.
The thesis deals with a question of redundancy in plant actin isotypes, especially in a case of Arabidopsis thaliana. Available proofs both confirm and disprove the redundancy of actin isotypes. Similarities and differences in gene structure are considered, as well as gene and protein sequence, expression, expression regulation and function. Despite conserved features as the gene structure, protein sequence, or higher similarity among ortologues than paralogues, there are differences in actin gene families such as the regulation of genes expression, the structure and function of non-coding sequences, or expression patterns. Moreover, actin isotypes divergetion times correlate with important events in plant evolution history. The thesis also deals with diverse functions of actin isotypes in plants. In addition, directions for future research are provided as well.