Vývoj grafického rozhraní pro zpracování MR spektroskopických vyšetření
The development of graphic user interface for processing of MR spectroscopy data
diploma thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/35056Identifiers
Study Information System: 90507
Collections
- Kvalifikační práce [4451]
Author
Advisor
Referee
Hačkajlo, David
Faculty / Institute
First Faculty of Medicine
Discipline
Medical technics and Informatics
Department
Institute of Biophysics and Informatics First Faculty of Medicine Charles University in Prague
Date of defense
29. 9. 2010
Publisher
Univerzita Karlova. 1. lékařská fakultaLanguage
Czech
Grade
Very good
Účelem této diplomové práce bylo zjednodušení zpracovaní spektroskopických dat a vytvořeni databáze provedených MR vyšetřeni. Výchozí stav ukládání MR dat vyžadoval ovládání několika programů. Proto bylo nutné vytvořit ovládací rozhraní, které obsahuje potřebné funkce a je přizpůsobeno požadavkům personálu, který vyšetření zpracovává. Výzkum a vývoj softwaru probíhal v Institutu Klinické a Experimentální Medicíny na pracovišti MR spektroskopie ZRIR IKEM. Výsledkem diplomové práce je rozhraní, které ovládá stávající MR spektroskopicky PACS (SPACS) určeny pro archivaci a správu dat pacientů výzkumných MR projektů v IKEM. Aplikace je dostupná přes webový prohlížeč. Všechny funkce, výpočty a náhledy jsou vytvořeny v programovacím jazyku PHP, použita databáze je implementovaná v PostgreSQL, doplňkové funkce a drobné utility zajišťuje Javascript Aplikace umožňuje zobrazit bázové obrázky s vykreslenou oblasti zajmu, vygenerovat z naměřených dat náhled spektra, zvolit parametry pro zpracování a odeslat všechna data do výpočetní jednotky LCModel. Samozřejmosti je přehledné ukládání výsledků do databáze. Aplikace byla otestovaná a umístěná na hlavní SPACS server v IKEMu a uživatelům ulehčuje zpracovávání spektroskopických vyšetření.
The aim of this thesis is to simplify the processing of spectroscopy data and to create the database of the performed examinations. Currently several programs have to be run, to completely process the measured data. That is why it was necessary to create the user interface, which contains all necessary features and which is tailored to the requirements of the staff processing the data. The research and the development of the program was performed at the department of MR spectroscopy IKEM. The output of the thesis is the graphical interface that controls existing patient management application SPACS used for the archivation and management of the patient data within research projects in MR in IKEM. The application is available via the web browser. All functions, calculations, and views are created in the PHP language, the database is implemented in PostgreSQL and all additional features and utilities are provided by JavaScript language. The application is able to display base images with a volume of interest, to generate the preview of the spectrum from the raw data, to select the processing parameters and to send the data to processing by the LCModel program. The results are consequently saved into the database. The application has been tested and uploaded to the main SPACS server in IKEM and facilitates the...