Genetická variabilita ohrožených želv Orlitia borneensis chovaných v evropských zoologických zahradách
Genetic variability in a population of endangered turtle Orlitia borneensis kept in European zoos
diploma thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/33760Identifiers
Study Information System: 81243
Collections
- Kvalifikační práce [20115]
Author
Advisor
Referee
Hulva, Pavel
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Clinical and Toxicological Analysis
Department
Department of Zoology
Date of defense
3. 6. 2011
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Very good
Keywords (Czech)
Orlitia borneensisKeywords (English)
Orlitia borneensisOrlitia borneensis, jinak také nazývána Malajská obří želva, je velmi málo prozkoumaný druh želvy, jehož populace se v přírodě rapidně zmenšují. Většina zvířat chovaných v evropských zoologických zahradách a také v záchranných chovech pochází z konfiskátů, proto je místo původu a taxonomický status u těchto zvířat neznámý. Tato studie je zaměřena na posouzení genetické variability zakladatelských jedinců z této populace. Byl sekvenován mitochondriální úsek pro gen cytochrom b a bylo nalezeno 23 haplotypů. Maximální sekvenční divergence byla menší než 1,5% a fylogenetická struktura získaných haplotypů byla jen špatně podpořena. Blízká genetická příbuznost vzorkovaných želv byla potvrzena analýzou sekvencí jaderného genu R35. Není tedy důvod k rozdělení zkoumané populace O. borneensis na více konzervačních jednotek.
Malaysian Giant Turtle (Orlitia borneensis) in poorly known turtle with rapidly descending numbers in nature. Most animals of this species kept in European zoos and included in captive breeding program are confiscates of illegal trade and their locality of origin and taxonomic status are unknown. This study was aimed to assess genetic variation in founders of this population. We sequenced genes for the mitochondrial cytochrome b and found 23 haplotypes. The maximum sequence divergence was less than 1.5% and the phylogenetic structure of the haplotypes was only poorly supported. A close genetic similarity among sampled turtles was further confirmed by a sequencing of the nuclear R35 gene. Thus, the examined population of O. borneensis may be further treated as a single conservation unit.