Gene flow and its consequences for microevolution in Taraxacum (Asteraceae)

Abstract

Souhrn Mikrosatelity(SIR,)se vyskytujív hojnémpočtuv genomechvšechŽijícíchorganismů,kde jsou téměřrovnoměrněrozmÍstěny,tudížjako analytickýchmarkerŮjich lze využÍtprakticky pro jakýkolivgenetickýúčeLNěkteréSIR /okusyvykazujíextrémněvysokou alelickou variabilitu.Jsou obecně snadno izolovatelnéi z velmiomezenéhozdroje DNA a rychlereplikovatelnépolymerázovou řetězovou reakcÍ(PCR) Díky svým mimořádným vlastnostemse sťa/yatraktivníma populárnÍm nástrojemv mnoha biologickýchaplikacích,Jádro diseftačnípráce tvořípět kapitolpředstavujÍcÍch projekty,v nichžjsme studovaliautozomálnínebo na chromozomY vázané STR lokusy' NašecÍle bylynásledujÍcÍ:(i)Prozkoumatalelickéfrekvencev souboruautozomálníchSTR markerŮ,odhadnout standardnÍpopulačněa forenzněgeneticképarametrya provéstmezipopulačnÍsrovnánÍalelických frekvencÍ;(ii) navrhnout pŮvodnÍ Y_chromozomálnÍSTR multiplex sysÍémk analýze vysoce polymoffníchlokusůa vyhodnotitjej s ohledemna možnévyužitÍpro forenzněa populačněgenetické účely;a (iii)uskutečnitprunÍstudiiu skupinydruhuPan paniscus,v nÍžby kombinacebehaviorálních údajŮo samčÍsociálnÍhierarchiia samčÍmúspéchuv pářenÍa paternitnÍchdat umožnilaprověřit Vzorec vztahŮ mezi těmito proměnnými a následně zhodnotit možnédŮsledky stanovených přÍbuzenskýchvztahŮpro chovná opatřeníve skupině.S těmitozáměry...

Microsatellites(SIR) are very abundantand spread over the entire genome of all living organisms,so markers can be developedfor any genetic objective.Some SfRs exhibit very high levels of allelic variation.SIRs are generallyeasy to obtain and rapidlyassayed using polymerase chain reaction (PCR), requiringonly minute amountsof biologicalmaterial.Their distinctattributes made them attractiveand the popular tool of choice in a numberof applicationswithinthe area of biology' The core of this Íheslsconslsts of five chaptersrepresentingsťudieswhere we investigated autosomal or Y_linked SIRs Íocarry out our tasks. our objectives Were (i) to investigateallele frequencies for a set of autosomal SIRS, to estimatestandard population and forensic genetic parameters,and to perŤorman inter_populationcomparisonof allele frequencydata;(ii)to design a novel PCR-based Y chromosomeSIR multiplexassay for the analysisof highlydiverseloci, and to evaluateťhissysťemfor forensicand populationgenetic purposes;and (iii)to carryout the firststudy in a Pan paniscusgroup wherea combinationof behaviouraldata on male dominancerank and matingsuccess withgeneticdataonpaternityallowsthetestingof thepatternof relationshipsbetween thesevariables,and to evaluatepossib/econsequencesof the establishedgenetic relationshipsfor...