Role N-glykosylace v homooligomerizaci receptoru přirozené cytotoxicity NKp30
The role of N-glycosylation in homooligomerization of natural cytotoxicity receptor NKp30
diploma thesis (DEFENDED)

View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/181220Identifiers
Study Information System: 242895
Collections
- Kvalifikační práce [20798]
Author
Advisor
Consultant
Skořepa, Ondřej
Referee
Bělonožníková, Kateřina
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Physical Chemistry with specialisation in Biophysical Chemistry
Department
Department of Physical and Macromolecular Chemistry
Date of defense
30. 5. 2023
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
NK buňky, NKp30, HEK293T, N-glykosylace, oligomer, oligomerizaceKeywords (English)
NK cells, NKp30, HEK293T, N-glycosylation, oligomer, oligomerizationNK buňky hrají klíčovou roli v boji proti buňkám, které byly napadeny virem, prvokem nebo podlehly maligní transformaci. Kromě toho také regulují aktivitu a množství dalších buněk imunitního systému. Cílové buňky rozpoznávají pomocí svých aktivačních a inhibičních receptorů, ze kterých přijímají aktivační a inhibiční signály, na nichž je závislá cytotoxická odpověď NK buňky. Mezi signály panuje dynamická rovnováha, která rozhoduje o životě a smrti cílové buňky. Pokud převáží aktivační signály, bude cílová buňka eliminována. Pokud převáží inhibiční signály, pak cytotoxická odpověď nenastane. Receptor NKp30 patří do superrodiny receptorů podobných imunoglobulinům. Jedná se o důležitý aktivační receptor, který rozpoznává celou řadu ligandů, mezi které patří hemaglutinin viru vakcinie a ektromélie, protein pp65 lidského cytomegaloviru, B7-H6, BAG-6 a galektin-3. Extracelulární doména receptoru NKp30 je za určitých podmínek schopna v roztoku homooligomerizovat. První podmínkou je přítomnost N-glykosylace, druhou podmínkou je přítomnost 15 aminokyselin dlouhé "stalk" domény, která propojuje ligand vázající doménu s transmembránovým α-helixem. Cílem této práce bylo ověřit, které ze třech dostupných míst N-glykosylace receptoru NKp30 je zodpovědné za jeho homooligomerizaci. Dalším cílem byla biofyzikální...
NK cells play a key role in the defence against cells that have been infected by a virus, a protozoan or have undergone malignant transformation. In addition, they also regulate the activity and quantity of other cells of the immune system. Target cells are recognized using their activating and inhibitory receptors, from which they receive activating and inhibitory signals, on which the cytotoxic response of NK cells depends. There is a dynamic balance between the signals that determines the life and death of the target cell. If activation signals prevail, the target cell will be eliminated. If inhibitory signals prevail, then a cytotoxic response will not be triggered. The NKp30 receptor, which belongs to the immunoglobulin-like receptor superfamily, is an important activating receptor that recognizes a number of ligands, including hemagglutinin of vaccinia and ectromelia virus, human cytomegalovirus pp65 protein, B7-H6, BAG-6, and galectin-3. The extracellular domain of the NKp30 receptor is capable of homooligomerization in solution under certain conditions. The first requirement is the presence of N-glycosylation, the second requirement is the presence of a 15 amino acid long "stalk" domain that connects the ligand binding domain with the transmembrane α-helix. The aim of this thesis was to...