Environmental drivers of microbial community composition in a temperate forest
Environmentální faktory ovlivňující složení mikrobiálních společenstev v lese mírného pásu
dissertation thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/177152Identifiers
Study Information System: 176755
Collections
- Kvalifikační práce [20073]
Author
Advisor
Referee
Vašutová, Martina
Kopecký, Jan
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Molecular and Cellular Biology, Genetics and Virology
Department
Department of Genetics and Microbiology
Date of defense
16. 9. 2022
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
English
Grade
Pass
Keywords (Czech)
temperate forests, soil, bacteria, fungi, ecologyKeywords (English)
temperate forests, soil, bacteria, fungi, ecologyV poslední době se do popředí zájmu dostává úloha lesů v globálním koloběhu uhlíku. Mikroorganismy jsou klíčovou součástí koloběhu uhlíku v lesních ekosysémech, kde se účastní důležitých ekosystémových procesů. Jedním z nich je degradace uhlíkatých sloučenin, od jednoduchých po velice obtížně rozložitelné, přičemž většina studií se zaměřovala na houby. Teprve nedávno se ukázalo, že i bakterie jsou schopné rozkládat komplexní rostlinné polymery v půdě a že v koloběhu uhlíku mohou hrát stejně důležitou úlohu jako houby. Kromě toho máme velmi omezené znalosti o časové dynamice houbových a bakteriálních společenstev a o tom, jak na ně působí různé faktory prostředí. Hlavním cílem této dizertace je zodpovědět na výše naznačené otázky (1) určením rychlosti obratu houbových a bakteriálních společenstev v půdách lesů mírného pásma, (2) popsáním faktorů ovlivňujících strukturu houbových společenstev smrkového a bukového porostu v průběhu jejich dlouhodobého vývoje, (3) určením podílu hub a bakterií na rozkladu různých uhlíkatých sloučenin v lesní půdě a (4) popsáním vývoje bakteriálních společenstev v reakci na vykácení smrkového porostu. Výzkum mikroorganismů zajišťujících klíčové ekosystémové procesy včetně rozkladu a koloběhu uhlíku je zásadní pro pochopení budoucího vývoje uhlíkové bilance v rámci...
Recently, much attention has been focused on the importance of forests to the global carbon cycle. Microorganisms are a critical component of the carbon cycle in forests, participating in important ecosystem processes and degrading various carbon compounds, from simple to highly recalcitrant compounds. However, most studies in this regard have focused on fungi. Only in recent years has it become known that bacteria are also capable of degrading complex plant polymers in soil, and that their contribution to the carbon cycle may be as important as that of fungi. Furthermore, our knowledge of the temporal dynamics of both fungal and bacterial communities is limited, as well as their response to different environmental drivers. The main objective of this dissertation was to fill these knowledge gaps by (1) quantifying the rate of temporal turnover of fungal and bacterial communities in soils of temperate forests, (2) describing the factors that shape fungal communities in spruce and beech stands during their long-term development (stand age), (3) assessing the contribution of fungi and bacteria to the utilisation of different carbon sources in forest soils, and finally (4) describing the development of bacterial communities in response to clearcutting of a spruce stand. The study of microbes...