Coding of pheromone signal by olfactory receptor neurons in Agrotis ipsilon
Kódování feromonového signálu olfaktorními neurony motýla Agrotis ipsilon
diploma thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/176814Identifiers
Study Information System: 231371
Collections
- Kvalifikační práce [20084]
Author
Advisor
Consultant
Novotný, Jiří
Referee
Pokora, Ondřej
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Animal Physiology with specialisation in Animal and Human Physiology
Department
Department of Physiology
Date of defense
7. 9. 2022
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
English
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
početní neurovědy, neuronální kódování, feromon, Agrotis ipsilon, olfaktorní recepční neuron, biofyzikální modelováníKeywords (English)
computational neuroscience, neural coding, pheromone, Agrotis ipsilon, olfactory receptor neuron, biophysical modelingHlavním cílem této diplomové práce je popsat, zdali a jak se liší aktivita olfaktorních recepčních neuronů u samců A. ipsilon při stimulaci samičím pohlavním feromonem s různou časovou dynamikou koncentrace, tedy buďto umělým konstantním pulsem nebo přerušovaným signálem podobným přirozené stimulaci. Za tímto účelem byla ve spolupracující laboratoři (Dr. P. Lucas, INRAe, Versailles, France) získána experimentální data za použití nového olfaktometrického systému umožňujícího přesnou kontrolu nad časováním dodávek feromonu k sensillu. Byla provedena analýza odpovědi pomocí řady různých kvantifikátorů spolehlivosti, náhodnosti a variability v programovacím jazyce R. Výsledky byly interpretovány v kontextu klasické hypotézy efektivního kódování, která říká, že senzorické neurony jsou evolučně adaptovány na přirozenou stimulaci. Hlavní zjištění je, že ačkoli variabilita odpovědi celé populace ORN na fluktuující nebo konstantní stimulaci se ne vždy liší, na úrovni individuálních neuronů je odpověď na fluktuující stimulaci zpravidla méně variabilní, a tedy spolehlivější, než na stimulaci konstantní. Diplomová práce rovněž shrnuje důležitá fakta a hypotézy týkající se neuronálního kódování a olfakce u Lepidoptera.
i Abstract The main objective of the thesis is to describe differences in the activity of male A. ipsilon olfactory receptor neurons (ORNs) when stimulated by different temporal dynamics of the concentration of the conspecific female pheromone. First, under the artificial situation of constant pulse stimulation, and second, with a fluctuating signal resembling the natural situation. For this purpose, the experimental data were collected in the collaborating laboratory (Dr. P. Lucas, INRAe, Versailles, France) by employing a novel olfactometer system that enables precise temporal control of the pheromone delivery to individual sensilla. Using the R programming language, we analyzed various descriptors of the response reliability, randomness, and variability, as well as the information content of the evoked activity. The results are interpreted in the context of the classical efficient coding hypothesis, which states that sensory neurons are evolutionarily adapted to natural stimuli. The main finding is that although the response variability is widely spread across the ORN population, sometimes with no visible difference between the constant and fluctuating stimulation types, the fluctuating stimulus is usually encoded with systematically higher reliability, as revealed by the inspection of individual ORNs....