Neadiabatická molekulová dynamika fotochemických procesů akcelerovaná pomocí strojového učení
Non-adiabatic molecular dynamics of photochemical processes accelerated by machine learning
diploma thesis (DEFENDED)

View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/176806Identifiers
Study Information System: 227452
Collections
- Kvalifikační práce [20329]
Author
Advisor
Referee
Sršeň, Štěpán
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Physical Chemistry with specialisation in Modelling of chemical properties of nanostructures and biostructures
Department
Department of Physical and Macromolecular Chemistry
Date of defense
12. 9. 2022
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
strojové učení neadiabatická molekulová dynamikaKeywords (English)
machine learning nonadiabatic molecular dynamicsNeadiabatická molekulová dynamika je významným přístupem pro studium fotochemických jevů. Pomocí stochastického algoritmu a sady trajektorií je možné studovat jevy, při kterých selhává Bornova-Oppenheimerova aproximace. Tento přístup je však omezen velikostí molekul a délkou časových intervalů, které je možné studovat. Pomocným nástrojem mohou být techniky strojového učení, jež se osvědčily v mnoha různých oblastech. V této práci se zaměřuji na použitelnost techniky jádrové ridge regrese jako potenciálního nástroje pro akceleraci simulací neadiabatické molekulové dynamiky. Vinyl bromid je malá molekula s těžkým atomem bromu, což z výpočetního hlediska představuje vhodný testovací systém pro neadiabatickou molekulovou dynamiku se zahrnutím neadiabatických a spinorbitálních vazeb.
Nonadiabatic molecular dynamics is an important approach for the study of photochemical phenomena. Using a stochastic algorithm and a set of trajectories, it is possible to study phenomena where the Born-Oppenheimer approximation breaks down. This approach is limited by the size of the molecule and the length of time intervals that can be studied. Machine learning techniques, which have proven themselves in many different fields, can be a helpful tool. In this thesis, I focus on the applicability of a kernel ridge regression technique as a potential tool for accelerating nonadiabatic molecular dynamics simulations. Vinyl bromide is a small molecule with a heavy bromine atom, which from a computational point of view represents a suitable test system for nonadiabatic molecular dynamics with the inclusion of non-adiabatic and spinorbital couplings.