Evolution of the genus Arabidopsis in its centre of diversity
Evoluce v centru diverzity rodu Arabidopsis
dizertační práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/172268Identifikátory
SIS: 128202
Kolekce
- Kvalifikační práce [19114]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Greimler, Josef
Mártonfi, Pavol
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Botanika
Katedra / ústav / klinika
Katedra botaniky
Datum obhajoby
25. 3. 2022
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Angličtina
Známka
Prospěl/a
Klíčová slova (česky)
Arabidopsis halleri, Arabidopsis arenosa, fylogeografie, genetická diverzita, autopolyploidie, taxonomieKlíčová slova (anglicky)
Arabidopsis halleri, Arabidopsis arenosa, phylogeography, genetic diversity, autopolyploidy, taxonomyPředpokladem pro řešení obecných otázek týkajících se vývoje vnitrodruhové variability v prostoru a čase je znalost rozložení variability v rámci areálu druhu. Velkým krokem kupředu byl rozvoj molekulárních metod, které umožnily řešení různých evolučních otázek za využití přirozených populací modelových druhů a jejich blízkých příbuzných. Ačkoli jsou volně žijící příbuzní Arabidopsis thaliana v centru pozornosti rostlinných evolučních biologů a molekulárních genetiků již dlouhou dobu, rozložení jejich genetické diverzity a fenotypové variability v přirozených populacích jsou často přehlíženy. Předkládaná práce se zaměřuje na jedny z nejstudovanějších modelových druhů v čeledi Brassicaceae, druh Arabidopsis halleri a druhový komplex A. arenosa, jejichž příslušníci jsou hojně využíváni pro studium ekologie, fyziologie a evoluce i molekulárních základů fytoremediace nebo paralelní adaptace. Cílem studie bylo zjistit vnitrodruhovou variabilitu na ploidní úrovni, odhalit fylogenetické vztahy a prostorové rozložení genetické diverzity v celém areálu výskytu a navrhnout nový taxonomický koncept založený na zjištěné vnitrodruhové variabilitě. Výsledků bylo dosaženo pomocí DNA průtokové cytometrie, několika molekulárních metod (AFLP, SSR, sekvenování cpDNA a single/low-copy genů, ddRADSeq, celogenomové...
A prerequisite for addressing general questions concerning the evolution of intraspecific variability in space and time is the knowledge of the distribution of variability within the species' range. The development of molecular methods has been a major step forward, allowing various evolutionary questions to be addressed using natural populations of model species and their close relatives. Although wild relatives of Arabidopsis thaliana have long been in the focus of plant evolutionary biologists and molecular geneticists, the patterns of genetic diversity and phenotypic variation in their natural populations are often overlooked. The present work focuses on some of the most studied model species in the Brassicaceae family, Arabidopsis halleri and the complex of A. arenosa, whose members are widely used to study ecology, physiology and evolution as well as the molecular basis of phytoremediation and parallel adaptation. The study aimed to determine intraspecific variation at the ploidy level, to reveal phylogenetic relationships and the spatial distribution of genetic diversity across the range, and to propose a new taxonomic concept based on the detected intraspecific genotypic and phenotypic variation. In order to accomplish this goal, we used DNA flow cytometry, several molecular methods (AFLP,...
Citace dokumentu
Metadata
Zobrazit celý záznamSouvisející záznamy
Zobrazují se záznamy příbuzné na základě názvu, autora a předmětu.
-
Systematika a fylogeografie diploidních zástupců druhového komplexu Arabidopsis arenosa
Výsledek obhajoby: OBHÁJENOHyklová, Lucie (Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2016)Datum obhajoby: 14. 9. 2016Druhový komplex Arabidopsis arenosa je blízce příbuzný modelovému druhu Arabidopsis thaliana. Areál rozšíření diploidní linie pokrývá větší část střední a jihovýchodní Evropy s pozoruhodnou diverzitou ekologických nik od ... -
Evolution of the genus Arabidopsis in its centre of diversity
Výsledek obhajoby: UZNÁNOŠrámková, Gabriela (Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2022)Datum obhajoby: 17. 6. 2022A prerequisite for addressing general questions concerning the evolution of intraspecific variability in space and time is the knowledge of the distribution of variability within the species' range. The development of ... -
Bližší charakterizace gene trap linie MGT180 a jejích kandidátních genů
Výsledek obhajoby: OBHÁJENOŠnajdrová, Tereza (Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2015)Datum obhajoby: 14. 9. 2015Tvorba postranních kořenů umožňuje rostlinám dobývat půdní prostředí, efektivně získávat vodu a minerální látky či tvořit různé biotické interakce. Vznik postranních kořenů je u Arabidopis thaliana vázán na buňky pericyklu, ...