Úloha helikáz UAP56 a URH49 při virové infekci
Role of helicases UAP56 and URH49 in viral infection
bakalářská práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/126281Identifikátory
SIS: 231557
Kolekce
- Kvalifikační práce [19113]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Šmahel, Michal
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Molekulární biologie a biochemie organismů
Katedra / ústav / klinika
Katedra genetiky a mikrobiologie
Datum obhajoby
1. 6. 2021
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Čeština
Známka
Výborně
Klíčová slova (česky)
helikázy, DEAD-box, URH49, DDX39A, UAP56, DDX39B, životní cyklus viruKlíčová slova (anglicky)
helicases, DEAD-box, URH49, DDX39A, UAP56, DDX39B, viral life cycleHelikázy jsou proteiny s katalytickou schopností odvíjení dvouřetězcových nukleových kyselin. Významnou skupinou jsou helikázy s motivem DEAD, do nichž se řadí helikázy UAP56 a nověji objevená URH49. Jedná se o orthology a sdílí některé funkce. Obě helikázy se účastní sestřihu pre-mRNA a podílí se na transportu mRNA z jádra do cytoplazmy. Mírné odlišnosti obou helikáz mohou způsobovat odlišnou afinitu k různým mRNA. Nadprodukce helikázy URH49 byla zaznamenána v mnoha rakovinných tkáních, a proto bylo navrženo, že by mohla fungovat jako potenciální biomarker nepříznivých prognóz nádorových onemocnění. Asociace helikáz UAP56 a URH49 s jaderným exportem vedla k výzkumu jejich role při infekci buněk viry, které se replikují v jádře. Ukázalo se, že helikázy UAP56 a URH49 podporují replikaci virů několika způsoby. Buď se účastní transportu virových RNA do cytoplazmy a napomáhají tak k translaci pro virus důležitých proteinů či hrají roli v jejich enkapsidaci. Dále napomáhají rekrutování exportního komplexu, který je za normálních okolností závislý na tvorbě sestřihového aparátu, k virovým transkriptům bez intronů. U helikázy URH49 byla dále popsána aktivita vedoucí k potlačení jaderného exportu protivirových transkriptů. Klíčová slova: helikázy, DEAD-box, URH49, DDX39A, UAP56, DDX39B, životní cyklus viru
Helicases are proteins with the catalytic ability to unwind double-stranded nucleic acids. An important group are helicases with a DEAD motif, which includes helicase UA56 and the more recently discovered helicase URH49. These helicases are orthologs and they share some functions. Both helicases are involved in the splicing of pre-mRNA and they take part in the transport of mRNA from the nucleus to the cytoplasm. Slight differences between the two helicases lead to different affinites for different mRNAs. Overproduction of the URH49 helicase has been reported in many cancer tissues and has therefore been suggested to function as a potential biomarker of adverse cancer prognosis. The association of helicases UAP56 and URH49 with nuclear export has led to research of their role in cells infected by viruses which replicate in the nucleus. The helicases UAP56 and URH49 have been shown to promote virus replication in several ways. They either participate in the transport of viral RNAs into the cytoplasm and thus help to translate important proteins for the virus or play a role in their encapsidation. They also help recruit the export complex, which is normally dependent on the formation of a splicing apparatus, to viral transcripts without introns. The URH49 helicase has also been described to suppress...