Genomic instability associated with formation of RNA:DNA hybrids and molecular mechanisms of its suppression
Genomová nestabilita spojená se vznikem RNA:DNA hybridů a mechanismy jejího potlačení
dizertační práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/124435Identifikátory
SIS: 170888
Kolekce
- Kvalifikační práce [20083]
Autor
Vedoucí práce
Konzultant práce
Janščák, Pavel
Oponent práce
Hanzlíková, Hana
Šolc, Petr
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Vývojová a buněčná biologie
Katedra / ústav / klinika
Katedra buněčné biologie
Datum obhajoby
26. 1. 2021
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Angličtina
Známka
Prospěl/a
Klíčová slova (česky)
R-smyčky, RNA:DNA hybridy, replikační stres, transkripční stres, genomová stabilitaKlíčová slova (anglicky)
R-loops, RNA:DNA hybrids, replication stress,transcription stress, genome stabilityJednou z nejrozšířenějších infekcí lidského organizmu je infekce žaludku způsobená patogenní bakterií Helicobacter pylori (H. pylori). Předpokládá se, že tímto patogenem je nakažená každá druhá osoba a prevalence nákazy výrazně stoupá v méně rozvinutých zemích. H. pylori, jako nenápadný nepřítel, může kolonizovat prostředí žaludku po desítky let bez toho, aby se projevil jakýkoliv příznak onemocnění u infikované osoby. Avšak dlouhodobá infekce může způsobit závažné poškození žaludeční tkáně a následné onemocnění žaludku, jakými jsou gastritida, vředová nemoc nebo rakovina. Až 80 % karcinomů žaludku je spojeno s infekcí H. pylori, která je považována za hlavní faktor pro rozvoj tohoto onemocnění. Dlouhodobá přítomnost bakterií v lidském hostiteli je zabezpečena produkcí bakteriálních virulentních faktorů, které svou aktivitou utlumují imunitní systém. Nevratné změny epitelu žaludku jsou vyvolané aktivací imunitní odpovědi infikovaných buněk zprostředkované mimo jiné ALPK1/TIFA/NF-κB signální dráhou. Aktivátorem této signální dráhy je β-ADP-heptóza, meziprodukt biosyntézy bakteriálního lipopolysacharidu. Již dříve bylo ukázáno, že infekce buněk H. pylori a aktivace ALPK1/TIFA/NF-κB signální dráhy je spojena se zvýšeným výskytem dvouvláknových zlomů v DNA hostitelských buněk. My jsme pozorovali, že...
One of the most common infections of a human organism is an infection of stomach induced by pathogenic bacteria Helicobacter pylori (H. pylori). It is estimated that every second person is infected, with even higher prevalence in developing countries. As a quiet enemy, H. pylori can colonise a human stomach for decades without manifestation of infection-associated symptoms. However, chronic infection may cause severe damage to the stomach tissue, subsequently leading to the development of gastric diseases, including gastritis and ulcer disease. H. pylori infection is also a driving cause of gastric cancer, with 80% of gastric cancers being associated with chronic infection. H. pylori ensures its life-long persistence in a human host organism via the action of its virulence factors, which have a pleiotropic effect on multiple systems, mostly acting on the attenuation of a human immune system and the induction of atrophy of stomach tissue. The irreversible changes of stomach epithelium are induced by activation of an innate immune response in H. pylori-exposed epithelial cells through the stimulation of ALPK1/TIFA/NF-κB signalling pathway upon a recognition of β-ADP heptose, an intermediate product of bacterial lipopolysaccharide biosynthesis, and consequently leading to the formation of DNA...