Genome Assembly and Annotation of Biparental Bee Ceratina nigrolabiata
Assembly a anotace genomu včely Ceratina nigrolabiata s obourodičovskou péčí
diplomová práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/122023Identifikátory
SIS: 209550
Kolekce
- Kvalifikační práce [19066]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Kolísko, Martin
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Zoologie
Katedra / ústav / klinika
Katedra zoologie
Datum obhajoby
7. 9. 2020
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Angličtina
Známka
Výborně
Klíčová slova (česky)
obourodičovská péče, genomika, Hymenoptera, Insecta, Ceratina, kyjorožkyKlíčová slova (anglicky)
biparental care, genomics, Hymenoptera, Insecta, Ceratina, small carpenter beesObourodičovská péče je u blanokřídlého hmyzu málo prozkoumaný fenomén. Tento typ péče byl objeven a popsán z etologického hlediska u včely druhu Ceratina nigrolabiata v České republice. Jelikož ale obourodičovská péče není u hmyzu častým jevem, nedostatek genomických studií tohoto chování komplikuje porozumnění vzniku obourodičovské péče a její podstaty na genomické a fyziologické úrovni. Tato diplomová práce se zabývá analýzou genomu včely C. nigrolabiata. Obsahuje shrnutí známého rodičovského chování napříč hmyzem, charakteristiku včel rodu Ceratina, popis využitých genomických metod studia genomu a vytyčuje kandidátní geny pro připravovanou transkriptomickou studii obourodičovské péče této včely. Klíčová slova: obourodičovská péče, genomika, Hymenoptera, Insecta, Ceratina, kyjorožky
Biparental care in Hymenoptera is a little studied behaviour. This kind of parental care was discovered and the ethological aspect described in the bee Ceratina nigrolabiata from the Czech Republic and is well understood on the ethological level. However, biparental care is not a common behaviour and the lack of genomic studies of this behaviour complicates the understanding of the origin of the biparental care and its underlying pathways on the genomic and physiological level. This master's thesis presents the genome analyses of a biparental bee Ceratina nigrolabiata. It consists of a brief summary of the known parental behaviour across insects, characteristics of the genus Ceratina, summary of the used genomic methods and presents a candidate genes for the transcriptomic study of the biparental behaviour of Ceratina nigrolabiata. Key words: biparental care, genomics, Hymenoptera, Insecta, Ceratina, small carpenter bees