Příprava a testování nového proteinového senzoru mechanické tenze
Construction and evaluation of a novel protein mechanosensor
diploma thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/111126Identifiers
Study Information System: 196606
Collections
- Kvalifikační práce [19109]
Author
Advisor
Referee
Novotný, Ivan
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Cellular and Developmental Biology
Department
Department of Cell Biology
Date of defense
18. 9. 2019
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Very good
Keywords (Czech)
p130CAS, FRET, fokální adheze, mechanosensingKeywords (English)
p130CAS, FRET, focal adhesions, mechanosensingProtein p130Cas (lidský ortholog BCAR1) je jedním z hlavních substrátů kinázy Src a hraje tak důležitou roli v nádorové transformaci. Zvýšená exprese BCAR1 koreluje s růstem primárního nádoru, jeho agresivitou a zhoršenou prognózou onemocnění. Ve chvíli, kdy je protein lokalizován do fokálních adhezí slouží jako buněčný mechanosenzor a zprostředkovává interakci buňky s extracelulárním prostředím. Pro fungování proteinu jsou klíčové kotvící domény SH3 a CCH spolu se substrátovou doménou, která může být vlivem aplikované tenze natahována. Diplomová práce představuje nově zkonstruovaný FRET-biosenzor mechanické tenze založený na struktuře proteinu p130Cas. Senzor využívá kotvící domény p130Cas, díky kterým lokalizuje do fokálních adhezí a může detekovat mechanickou tenzi v živých buňkách. Klíčová slova: p130CAS, FRET, fokální adheze, mechanorecepce
The protein p130Cas (human ortholog BCAR1) is a major substrate for phosphorylation by the Src family kinase and plays a central role in oncogenic transformation. Increased level of BCAR1 correlates with primary tumour growth and cancer progression. Localized to focal adhesion, p130Cas serves as a mechanosensor and mediates key interactions with the extracellular environment. The structure of p130Cas is crucial for its function, mainly the anchoring domains SH3 and CCH, together with the substrate domain which is extended when under tension. This Master's thesis presents a newly developer FRET mechanosensor based on the structure of p130Cas. The sensor utilizes the anchoring domains of p130Cas for proper localization to focal adhesions, where it can detect tension in living cells. Key words: p130CAS, FRET, focal adhesions, mechanosensing